概括
基因 11194
象征 ABCB8
同义词 EST328128 | M-ABC1 | MABC1
描述 ATP绑定盒子亚家族B成员8
参考 MIM:605464|HGNC:HGNC:49|Ensembl:ENSG00000197150|HPRD:10400|Vega:Otthumg00000158686
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7Q36
Pascal P值 0.004
主持人 前扣带回皮层BA24
小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01106572 7 150744384 ACCN3; ABCB8 5.02E-4 0.45 0.047 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS768423 CHR20 4533820 ABCB8 11194 0.12 反式
RS10952299 7 150730220 ABCB8 ENSG00000197150.8 2.40018e-7 0.01 4710 gtex_brain_ba24
RS2303926 7 150733025 ABCB8 ENSG00000197150.8 7.74153E-7 0.01 7515 gtex_brain_ba24
RS35900662 7 150734380 ABCB8 ENSG00000197150.8 7.74153E-7 0.01 8870 gtex_brain_ba24
RS71712832 7 150744369 ABCB8 ENSG00000197150.8 1.08004E-6 0.01 18859 gtex_brain_ba24
RS11770520 7 150744922 ABCB8 ENSG00000197150.8 5.16454E-7 0.01 19412 gtex_brain_ba24
RS11977275 7 150747937 ABCB8 ENSG00000197150.8 1.2152E-6 0.01 22427 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG ABC转运蛋白 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标DN 124 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM胃癌化学敏感性 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因