基因页:ABCB8
概括?
基因 | 11194 |
象征 | ABCB8 |
同义词 | EST328128 | M-ABC1 | MABC1 |
描述 | ATP绑定盒子亚家族B成员8 |
参考 | MIM:605464|HGNC:HGNC:49|Ensembl:ENSG00000197150|HPRD:10400|Vega:Otthumg00000158686 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q36 |
Pascal P值 | 0.004 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01106572 | 7 | 150744384 | ACCN3; ABCB8 | 5.02E-4 | 0.45 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS768423 | CHR20 | 4533820 | ABCB8 | 11194 | 0.12 | 反式 | ||
RS10952299 | 7 | 150730220 | ABCB8 | ENSG00000197150.8 | 2.40018e-7 | 0.01 | 4710 | gtex_brain_ba24 |
RS2303926 | 7 | 150733025 | ABCB8 | ENSG00000197150.8 | 7.74153E-7 | 0.01 | 7515 | gtex_brain_ba24 |
RS35900662 | 7 | 150734380 | ABCB8 | ENSG00000197150.8 | 7.74153E-7 | 0.01 | 8870 | gtex_brain_ba24 |
RS71712832 | 7 | 150744369 | ABCB8 | ENSG00000197150.8 | 1.08004E-6 | 0.01 | 18859 | gtex_brain_ba24 |
RS11770520 | 7 | 150744922 | ABCB8 | ENSG00000197150.8 | 5.16454E-7 | 0.01 | 19412 | gtex_brain_ba24 |
RS11977275 | 7 | 150747937 | ABCB8 | ENSG00000197150.8 | 1.2152E-6 | 0.01 | 22427 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ABCB8_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG ABC转运蛋白 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |