基因页：SUPT16H
概括？
| 基因 | 11198 |
| 象征 | SUPT16H |
| 同义词 | cdc68 | factp140 | spt16 | spt16/cdc68 |
| 描述 | SPT16同源物，促进染色质重塑亚基 |
| 参考 | MIM：605012|HGNC：HGNC：11465|Ensembl：ENSG0000000092201|HPRD：16088|Vega：Otthumg0000000029685 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 14Q11.2 |
| Pascal P值 | 0.015 |
| Sherlock P值 | 0.704 |
| 支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.047 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0008159 | 正转录伸长因子活性 | 塔斯 | 10421373 | |
| 去：0008235 | 金属核糖肽酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006337 | 核小体拆卸 | 塔斯 | 10421373 | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
| 去：0006366 | RNA聚合酶II启动子的转录 | 塔斯 | 10421373 | |
| 去：0006281 | DNA修复 | IEA | - | |
| 去：0006260 | 基因复制 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005654 | 核质 | 经验 | 12676794 | |
| 去：0005694 | 染色体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome RNA Pol II转录 | 105 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RNA Pol II伸长复合物的反应组形成 | 45 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome伸长逮捕和恢复 | 32 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol II前转录事件 | 61 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张对Cantharidin DN的反应 | 69 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chung水泡细胞毒性 | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌ESR1的王转移 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 双龙血清敏感基因 | 90 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 艾布拉姆森与艾尔互动 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-133 | 142 | 148 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| mir-15/16/195/424/497 | 900 | 906 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
| mir-431 | 346 | 352 | 1a | HSA-MIR-431 | uguugcaggccguauga |
| mir-495 | 1099 | 1105 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
| HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu | ||||