基因Page:ADCY6

概括?
基因ID 112
Symbol ADCY6
同义词 AC6|LCCS8
描述 adenylate cyclase 6
参考 MIM:600294|HGNC:HGNC:237|Ensembl:ENSG00000174233|HPRD:02621|Vega:OTTHUMG00000170396
基因type protein-coding
Map location 12q13.12
Pascal p-value 0.018
Sherlock P值 0.516
eGene Meta

数据源中的基因
基因set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.6789

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AP006216.1 0.88 0.91
EPB41L1 0.87 0.89
SPATA2 0.87 0.89
ZBTB4 0.87 0.89
AGPAT3 0.86 0.88
NFE2L1 0.86 0.89
ATP2B3 0.85 0.84
FBXL18 0.85 0.89
AMIGO1 0.85 0.87
TRAPPC10 0.85 0.89
Top 10 negatively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
C1orf54 -0.53 -0.59
DBI -0.53 -0.60
SYCP3 -0.53 -0.60
GNG11 -0.51 -0.57
C1orf61 -0.51 -0.57
AF347015.21 -0.51 -0.50
C8orf59 -0.50 -0.49
AL050337.1 -0.49 -0.57
ST20 -0.48 -0.51
RHOC -0.47 -0.53

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000287 magnesium ion binding IEA -
GO:0004016 腺苷酸环化酶活性 IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007242 intracellular signaling cascade IEA -
GO:0006171 cAMP biosynthetic process IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0016021 integral to membrane IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG OOCYTE MEIOSIS 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GAP JUNCTION 90 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TASTE TRANSDUCTION 52 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GNRH SIGNALING PATHWAY 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PROGESTERONE MEDIATED OOCYTE MATURATION 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG VASOPRESSIN REGULATED WATER REABSORPTION 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG DILATED CARDIOMYOPATHY 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LPA4 PATHWAY 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALLING BY NGF 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DAG和IP3信令 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY EGFR IN CANCER 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NGF SIGNALLING VIA TRKA FROM THE PLASMA MEMBRANE 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMISSION ACROSS CHEMICAL SYNAPSES 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEURONAL SYSTEM 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME能量代谢的集成 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME OPIOID SIGNALLING 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CA DEPENDENT EVENTS 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组腺苷酸环化酶激活途径 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADENYLATE CYCLASE INHIBITORY PATHWAY 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEUROTRANSMITTER RECEPTOR BINDING AND DOWNSTREAM TRANSMISSION IN THE POSTSYNAPTIC CELL 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLC BETA MEDIATED EVENTS 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKA介导的CREB磷酸化 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMEMBRANE TRANSPORT OF SMALL MOLECULES 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
代谢调节中的反应组胰高血糖素信号传导 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY PDGF 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNAL TRANSDUCTION 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF INSULIN SECRETION BY GLUCAGON LIKE PEPTIDE1 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF INSULIN SECRETION 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INHIBITION OF INSULIN SECRETION BY ADRENALINE NORADRENALINE 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA I SIGNALLING EVENTS 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA S SIGNALLING EVENTS 121 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Z SIGNALLING EVENTS 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PHOSPHOLIPASE C MEDIATED CASCADE 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AQUAPORIN MEDIATED TRANSPORT 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF WATER BALANCE BY RENAL AQUAPORINS 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GABA B RECEPTOR ACTIVATION 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA受体激活 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY FGFR 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL UP 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP53 TARGETS 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCCLUNG CREB1 TARGETS UP 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 2G 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN IPS ICP WITH H3K27ME3 54 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K27me3 42 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-101 721 727 m8 HSA-MIR-101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
mir-128 723 729 1A HSA-MIR-128A UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
HSA-MIR-128B UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir-133 28 35 1A,m8 hsa-miR-133a UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU
hsa-miR-133b UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA
mir-135 2037 2043 1A hsa-miR-135a Uauggcuuuuuuuuccuauga
hsa-miR-135b UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
mir-182 1267 1273 1A hsa-miR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
hsa-miR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
hsa-miR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
miR-19 1211 1217 1A hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b ugugcaaauccaugcaaaacuga
miR-204/211 647 653 m8 HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
miR-26 1372 1378 1A hsa-miR-26a脑 Uucaaguaauccaggauaggc
hsa-miR-26bSZ uucaaguaauucaggauagguu
miR-27 723 730 1A,m8 hsa-miR-27a脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
mir-375 643 649 1A hsa-miR-375 UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA
miR-409-5p 2302 2308 1A hsa-miR-409-5p AGGUUACCCGAGCAACUUUGCA
mir-493-5p 428 434 1A hsa-miR-493-5p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
hsa-miR-493-5p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
miR-504 953 959 1A hsa-miR-504 AGACCCUGGUCUGCACUCUAU
miR-96 940 946 1A hsa-miR-96脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC
hsa-miR-96脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC
hsa-miR-96脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC