基因页：galnt5
概括？
| 基因 | 11227 |
| 象征 | galnt5 |
| 同义词 | galnac-t5 | galnact5 |
| 描述 | 多肽N-乙酰乳糖酰氨基转移酶5 |
| 参考 | MIM：615129|HGNC：HGNC：4127|HPRD：09970| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q24.1 |
| Pascal P值 | 0.62 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG10982635 | 2 | 158161728 | galnt5 | 5.915E-4 | -0.657 | 0.05 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005529 | 糖结合 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0004653 | 多肽N-乙酰乳糖酰氨基转移酶活性 | 艾达 | 10545594 | |
| 去：0004866 | 内肽酶抑制剂活性 | IEA | - | |
| GO：0016757 | 转移酶活性，转移糖基团 | IEA | - | |
| GO：0030145 | 锰离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006024 | 糖胺聚糖生物合成过程 | 塔斯 | 10545594 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0005575 | cellular_component | nd | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg o glycan生物合成 | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组o粘蛋白的糖基化 | 59 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 纽曼ERCC6靶向DN | 39 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wagner Apo2敏感性 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-27 | 39 | 46 | 1A，M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||