基因页:EGLN2
概括?
基因 | 112398 |
象征 | EGLN2 |
同义词 | eit6 | hif-ph1 | hifph1 | hph-1 | hph-3 | phd1 |
描述 | EGL-9家庭缺氧诱导因子2 |
参考 | MIM:606424|HGNC:HGNC:14660|ENSEMBL:ENSG00000269858|HPRD:06970|Vega:Otthumg00000182703 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.2 |
Pascal P值 | 0.279 |
Sherlock P值 | 0.219 |
胎儿β | 0.489 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08080060 | 19 | 41307090 | EGLN2 | 1.639E-4 | 0.349 | 0.033 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16894557 | CHR6 | 28999825 | EGLN2 | 112398 | 0.06 | 反式 | ||
RS17795337 | CHR6 | 136492658 | EGLN2 | 112398 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EGLN2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG肾细胞癌 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HIF2Pathway | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HIF1A途径 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组对缺氧HIF的低氧诱导因子HIF调节 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组氧依赖性脯氨酸羟基诱导因子α的羟基化 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |