概括
基因 112398
象征 EGLN2
同义词 eit6 | hif-ph1 | hifph1 | hph-1 | hph-3 | phd1
描述 EGL-9家庭缺氧诱导因子2
参考 MIM:606424|HGNC:HGNC:14660|ENSEMBL:ENSG00000269858|HPRD:06970|Vega:Otthumg00000182703
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.279
Sherlock P值 0.219
胎儿β 0.489
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08080060 19 41307090 EGLN2 1.639E-4 0.349 0.033 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16894557 CHR6 28999825 EGLN2 112398 0.06 反式
RS17795337 CHR6 136492658 EGLN2 112398 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肾细胞癌 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF2Pathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1A途径 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组对缺氧HIF的低氧诱导因子HIF调节 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氧依赖性脯氨酸羟基诱导因子α的羟基化 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因