Summary
GeneID 112399
Symbol EGLN3
同义词 HIFP4H3 | HIFPH3 | PHD3
描述 EGL-9家庭缺氧诱导因子3
参考 MIM:606426|HGNC:HGNC:14661|ENSEMBL:ENSG00000129521|HPRD:06972|Vega:Otthumg0000000029498
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q13.1
Pascal P值 0.062
Sherlock P值 0.544

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005506 iron ion binding IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15721254
: 0016706 氧化还原酶的活性,作用于配对供体,并掺入或还原分子氧,2-氧基谷氨酸酯作为一个供体,并将一个原子掺入两个供体中 IEA -
: 0016702 氧化还原酶活性,作用于单个供体,并掺入分子氧,掺入两个原子的氧气 IEA -
去:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
: 0031418 L-抗坏血酸结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006915 apoptosis IEA -
去:0019538 蛋白质代谢过程 IEA -
去:0055114 还原氧化 IEA -
细胞成分 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 cytoplasm IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
癌症中的KEGG途径 328 259 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG肾细胞癌 70 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID HIF2Pathway 34 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID HIF1A途径 19 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID HIF1 TFPathway 66 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组对缺氧HIF的低氧诱导因子HIF调节 25 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组氧依赖性脯氨酸羟基诱导因子α的羟基化 18 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP 276 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nagashima NRG1信号向上 176 123 All SZGR 2.0 genes in this pathway
维奇缺氧了 171 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Elvidge Hif1a靶向​​DN 91 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS DN 104 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
darwiche乳头状瘤进度风险 74 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1通过SMAD4 DN进行的Ramjaun凋亡 8 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1通过MAPK1 DN进行的Ramjaun凋亡 8 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
田中甲基化食管癌中的甲基化 103 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li Cisplatin抗性 28 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 All SZGR 2.0 genes in this pathway
仅通过ELK3的高度缺氧 33 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wotton Runx目标DN 29 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤分化了井和dn不良的井 382 224 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR UP 116 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN 428 306 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath ES 1 379 235 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS 988 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath SOX2目标 734 436 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马纳洛缺氧 207 145 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 All SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 5 482 296 All SZGR 2.0 genes in this pathway
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 All SZGR 2.0 genes in this pathway
coates巨噬细胞M1与M2 DN 78 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN 543 317 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
iwanaga致癌作用 181 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C簇DN 32 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C DN 59 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF DN的响应 235 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 245 150 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌生存率差A6 456 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标36小时DN 185 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4Me3和H3K27Me3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein Esrra目标 535 325 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Qi缺氧 140 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR DN 91 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN 505 328 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王掺杂基因被SIRT1抑制 28 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vandesluis Commd1目标3 89 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fardin缺氧11 32 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ERBB2同工型的Pedersen转移5 11 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smirnov对IR 6小时DN的响应 114 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM监管机构 238 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 330 336 M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 328 335 1A,M8 HSA-MIR-17-5P CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
hsa-miR-519d caaagugccucccuuuagugugu
mir-9 72 78 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga