基因页：PRRT2
概括？
| 基因 | 112476 |
| 象征 | PRRT2 |
| 同义词 | bfic2 | bfis2 | dspb3 | dyt10 | ekd1 | ficca | icca | ifitmd1 | pkc |
| 描述 | 富含脯氨酸的跨膜蛋白2 |
| 参考 | MIM：614386|HGNC：HGNC：30500|ENSEMBL：ENSG00000167371|HPRD：13995|Vega：Otthumg00000177142 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p11.2 |
| Pascal P值 | 0.021 |
| 胎儿β | -0.581 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05995267 | 16 | 29822529 | PRRT2 | -0.041 | 0.33 | DMG：Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0009607 | 对生物刺激的反应 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Corre多发性骨髓瘤DN | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-132/212 | 649 | 655 | M8 | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
| HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
| mir-133 | 931 | 937 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu | ||||
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| mir-150 | 37 | 43 | M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
| mir-30-5p | 131 | 138 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-495 | 1006 | 1012 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
| mir-9 | 933 | 939 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |