基因页:HRH3
概括?
基因 | 11255 |
象征 | HRH3 |
同义词 | GPCR97 | HH3R |
描述 | 组胺受体H3 |
参考 | MIM:604525|HGNC:HGNC:5184|ENSEMBL:ENSG00000101180|Vega:Otthumg0000000032899 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.33 |
Pascal P值 | 0.054 |
Sherlock P值 | 0.507 |
胎儿β | -1.658 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16838771 | CHR1 | 157511227 | HRH3 | 11255 | 0.18 | 反式 | ||
RS9397728 | CHR6 | 150514248 | HRH3 | 11255 | 0.14 | 反式 | ||
RS558402 | Chr11 | 79016298 | HRH3 | 11255 | 0.2 | 反式 | ||
RS2906115 | CHR12 | 1248067 | HRH3 | 11255 | 0.14 | 反式 | ||
RS6055084 | CHR20 | 134475 | HRH3 | 11255 | 0.07 | 反式 | ||
RS1883665 | Chrx | 17650382 | HRH3 | 11255 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HRH3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0004969 | 组胺受体活性 | IEA | - | |
去:0004969 | 组胺受体活性 | 塔斯 | 10347254 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007269 | 神经递质分泌 | 塔斯 | 神经元,轴突,突触,5-羟色胺,神经递质,多巴胺(GO期限:8) | 10347254 |
去:0007187 | G蛋白信号传导,与环状核苷酸第二信使耦合 | 塔斯 | 10347254 | |
去:0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 10347254 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 10347254 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胺配体结合受体 | 38 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |