概括
基因 11255
象征 HRH3
同义词 GPCR97 | HH3R
描述 组胺受体H3
参考 MIM:604525|HGNC:HGNC:5184|ENSEMBL:ENSG00000101180|Vega:Otthumg0000000032899
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.33
Pascal P值 0.054
Sherlock P值 0.507
胎儿β -1.658
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16838771 CHR1 157511227 HRH3 11255 0.18 反式
RS9397728 CHR6 150514248 HRH3 11255 0.14 反式
RS558402 Chr11 79016298 HRH3 11255 0.2 反式
RS2906115 CHR12 1248067 HRH3 11255 0.14 反式
RS6055084 CHR20 134475 HRH3 11255 0.07 反式
RS1883665 Chrx 17650382 HRH3 11255 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004969 组胺受体活性 IEA -
去:0004969 组胺受体活性 塔斯 10347254
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007269 神经递质分泌 塔斯 神经元,轴突,突触,5-羟色胺,神经递质,多巴胺(GO期限:8) 10347254
去:0007187 G蛋白信号传导,与环状核苷酸第二信使耦合 塔斯 10347254
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 塔斯 10347254
去:0005887 质膜的积分 塔斯 10347254

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胺配体结合受体 38 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因