基因页：mgat4b
概括？
| 基因 | 11282 |
| 象征 | mgat4b |
| 同义词 | gnt-iv | gnt-ivb |
| 描述 | 甘露糖基（alpha-1,3-） - 糖蛋白β-1,4-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶，同工酶B |
| 参考 | MIM：604561|HGNC：HGNC：7048|ENSEMBL：ENSG00000161013|HPRD：05190|Vega：Otthumg00000130912 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q35 |
| Pascal P值 | 0.081 |
| Sherlock P值 | 0.136 |
| 胎儿β | 0.164 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.0276 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14446808 | 5 | 179233589 | mgat4b | 5.6e-8 | -0.014 | 1.45e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0008454 | α-1,3-甘露糖蛋白4-β-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶活性 | 塔斯 | 10372966 | |
| GO：0016758 | 转移酶活性，转移己糖基团 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006491 | N-聚糖处理 | 塔斯 | 10372966 | |
| 去：0005975 | 碳水化合物代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg n glycan生物合成 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome运输到高尔基体和随后的修改 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome N Glycan天线延伸 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome N Golgi内侧Golgi中的Glycan触角伸长 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过HIF1A的总缺氧 | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3和HIF1A DN的缺氧总缺氧 | 103 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 217 | 223 | M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-142-5p | 333 | 339 | M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
| mir-145 | 316 | 322 | 1a | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
| mir-199 | 314 | 321 | 1A，M8 | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
| HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
| mir-224 | 409 | 415 | M8 | HSA-MIR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
| mir-29 | 169 | 175 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-491 | 212 | 218 | 1a | HSA-MIR-491脑 | aguggggaacccuuccaugga |