基因页：CHRM2
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| 基因ID | 1129 |
| 象征 | CHRM2 |
| 同义词 | HM2 |
| 描述 | cholinergic receptor muscarinic 2 |
| 参考 | MIM：118493|HGNC：HGNC：1951|ENSEMBL：ENSG00000181072|HPRD：00328|Vega：Otthumg00000155658 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q31-Q35 |
| Pascal P值 | 0.166 |
| 胎儿β | -0.452 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | GPCR信号传导 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT：SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21127286 | 7 | 136555154 | CHRM2 | 2.55e-9 | -0.017 | 1.88e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG24845274 | 7 | 136555697 | CHRM2 | 9.93e-8 | -0.007 | 2.2e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PLA2G15 | 0.86 | 0.87 |
| ATP13A2 | 0.81 | 0.85 |
| Grin2d | 0.80 | 0.79 |
| PITPNM1 | 0.80 | 0.79 |
| ORAI2 | 0.80 | 0.82 |
| GDPD5 | 0.79 | 0.86 |
| TMEM163 | 0.78 | 0.82 |
| ABCA3 | 0.78 | 0.89 |
| DBNDD1 | 0.78 | 0.76 |
| ahnak2 | 0.77 | 0.82 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.53 | -0.68 |
| COPZ2 | -0.52 | -0.67 |
| AF347015.33 | -0.52 | -0.66 |
| AC021016.1 | -0.51 | -0.70 |
| MT-CO2 | -0.51 | -0.67 |
| AF347015.8 | -0.50 | -0.66 |
| mt-cyb | -0.50 | -0.65 |
| AF347015.2 | -0.50 | -0.62 |
| AF347015.27 | -0.50 | -0.66 |
| FXYD1 | -0.49 | -0.63 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0004981 | 毒蕈碱乙酰胆碱受体活性 | 塔斯 | 9603968 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 2739737 |
| 去：0007188 | G蛋白信号传导，耦合到CAMP核苷酸第二信使 | 塔斯 | 8139539 | |
| 去：0007207 | 毒蕈碱乙酰胆碱受体，磷脂酶C激活途径 | 塔斯 | 2739737 | |
| 去：0007213 | 乙酰胆碱受体信号传导，毒蕈碱途径 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0008016 | 心脏收缩的调节 | 塔斯 | 10544184 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005886 | 质膜 | 塔斯 | 3443095 | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 3037705 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组胺配体结合受体 | 38 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 92 | 99 | 1A，M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
| HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||