概括
基因 11311
象征 VPS45
同义词 H1 | H1VPS45 | SCN5 | VPS45A | VPS45B | VPS54A | VSP45 | VSP45A
描述 液泡蛋白排序45个同源物(S. cerevisiae)
参考 MIM:610035|HGNC:HGNC:14579|ENSEMBL:ENSG00000136631|HPRD:10301|Vega:Otthumg0000000012511
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.2
Sherlock P值 0.223
胎儿β 0.285
主持人 额叶皮质BA9
支持 细胞内贩运
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS140505938 CHR1 150031490 TC 9.337E-10 基因间 OTUD7B,VPS45 dist = 48804; dist = 7860


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006954 炎症反应 塔斯 10404641
去:0006904 囊肿囊肿的囊泡对接 IEA -
去:0006886 细胞内蛋白转运 塔斯 10404641
GO:0016192 囊泡介导的运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005798 高尔基体相关囊泡 塔斯 8996080
去:0005764 溶酶体 塔斯 8996080
去:0005768 内体 IEA -
去:0016020 IEA -
去:0010008 内体膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 132 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
整合素信号传导 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因