基因页:VPS45
概括?
基因 | 11311 |
象征 | VPS45 |
同义词 | H1 | H1VPS45 | SCN5 | VPS45A | VPS45B | VPS54A | VSP45 | VSP45A |
描述 | 液泡蛋白排序45个同源物(S. cerevisiae) |
参考 | MIM:610035|HGNC:HGNC:14579|ENSEMBL:ENSG00000136631|HPRD:10301|Vega:Otthumg0000000012511 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q21.2 |
Sherlock P值 | 0.223 |
胎儿β | 0.285 |
主持人 | 额叶皮质BA9 |
支持 | 细胞内贩运 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS140505938 | CHR1 | 150031490 | TC | 9.337E-10 | 基因间 | OTUD7B,VPS45 | dist = 48804; dist = 7860 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/VPS45_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0006954 | 炎症反应 | 塔斯 | 10404641 | |
去:0006904 | 囊肿囊肿的囊泡对接 | IEA | - | |
去:0006886 | 细胞内蛋白转运 | 塔斯 | 10404641 | |
GO:0016192 | 囊泡介导的运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005798 | 高尔基体相关囊泡 | 塔斯 | 8996080 | |
去:0005764 | 溶酶体 | 塔斯 | 8996080 | |
去:0005768 | 内体 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0010008 | 内体膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
整合素信号传导 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血中间祖先 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞DN | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |