基因页：CHRM5
概括？
| 基因 | 1133 |
| 象征 | CHRM5 |
| 同义词 | HM5 |
| 描述 | 胆碱能受体毒蕈碱5 |
| 参考 | MIM：118496|HGNC：HGNC：1954|HPRD：00331| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q26 |
| Pascal P值 | 0.131 |
| 胎儿β | -0.261 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑 皮质 海马 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT：SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS8038713 | CHR15 | 34276988 | CHRM5 | 1133 | 4.26E-4 | 顺式 | ||
| RS579975 | CHR15 | 34349223 | CHRM5 | 1133 | 0.03 | 顺式 | ||
| RS8038713 | CHR15 | 34276988 | CHRM5 | 1133 | 0.03 | 反式 | ||
| RS6495421 | 15 | 34276570 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.195E-7 | 0 | 15649 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6495422 | 15 | 34276599 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.194E-7 | 0 | 15678 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6495423 | 15 | 34276680 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 8.356e-8 | 0 | 15759 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6495424 | 15 | 34276738 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 8.371E-8 | 0 | 15817 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6495425 | 15 | 34276895 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 6.509E-8 | 0 | 15974 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6495426 | 15 | 34276899 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 6.399E-8 | 0 | 15978 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8038713 | 15 | 34276989 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 8.424e-8 | 0 | 16068 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1685119 | 15 | 34277053 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.32E-7 | 0 | 16132 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS517078 | 15 | 34277277 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.271E-7 | 0 | 16356 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11856529 | 15 | 34277377 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.036E-7 | 0 | 16456 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS489832 | 15 | 34277907 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.271E-7 | 0 | 16986 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS71119909 | 15 | 34278958 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.602E-8 | 0 | 18037 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS569035 | 15 | 34281327 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.27E-7 | 0 | 20406 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS563663 | 15 | 34281884 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.841E-7 | 0 | 20963 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS511422 | 15 | 34282982 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.27E-7 | 0 | 22061 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS478125 | 15 | 34284310 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 4.746E-8 | 0 | 23389 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12913747 | 15 | 34287060 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.521E-8 | 0 | 26139 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS544114 | 15 | 34288320 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.196E-7 | 0 | 27399 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34773983 | 15 | 34290364 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 29443 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS646950 | 15 | 34291660 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.916E-7 | 0 | 30739 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS536345 | 15 | 34291991 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 5.407E-7 | 0 | 31070 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS71462883 | 15 | 34292128 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 31207 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS644585 | 15 | 34292224 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.299E-7 | 0 | 31303 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11072868 | 15 | 34292591 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 31670 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS632591 | 15 | 34292635 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 5.324e-7 | 0 | 31714 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS618868 | 15 | 34293378 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 3.519E-7 | 0 | 32457 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS604041 | 15 | 34294428 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 5.674E-7 | 0 | 33507 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS603152 | 15 | 34294637 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 5.518e-7 | 0 | 33716 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS602807 | 15 | 34294657 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 5.518e-7 | 0 | 33736 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS144378883 | 15 | 34294730 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 5.526e-7 | 0 | 33809 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS602302 | 15 | 34294792 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 6.508E-7 | 0 | 33871 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4779652 | 15 | 34296119 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 35198 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6495442 | 15 | 34296424 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 35503 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6495443 | 15 | 34296512 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 35591 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS202008786 | 15 | 34297179 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 36258 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS66645361 | 15 | 34297180 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 36259 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7178075 | 15 | 34297495 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 36574 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7178446 | 15 | 34297721 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 36800 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7169003 | 15 | 34299326 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.523E-8 | 0 | 38405 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS635531 | 15 | 34299910 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.327E-7 | 0 | 38989 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS28870091 | 15 | 34300891 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.908E-7 | 0 | 39970 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12594902 | 15 | 34305274 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 7.082E-7 | 0 | 44353 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS71119912 | 15 | 34305274 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.287E-7 | 0 | 44353 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11635479 | 15 | 34306398 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 45477 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7162140 | 15 | 34310600 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 49679 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7173183 | 15 | 34312422 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 51501 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55805034 | 15 | 34313778 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.891E-7 | 0 | 52857 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS5016373 | 15 | 34314041 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.587E-7 | 0 | 53120 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2702282 | 15 | 34316062 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.531E-7 | 0 | 55141 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2702281 | 15 | 34317987 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.531E-7 | 0 | 57066 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS72718678 | 15 | 34321202 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.003e-8 | 0 | 60281 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12898898 | 15 | 34321205 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.003e-8 | 0 | 60284 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS72718682 | 15 | 34321241 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.003e-8 | 0 | 60320 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS67739072 | 15 | 34321318 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.003e-8 | 0 | 60397 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS66530874 | 15 | 34321339 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.003e-8 | 0 | 60418 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7175823 | 15 | 34321526 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.003e-8 | 0 | 60605 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12903907 | 15 | 34321981 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.003e-8 | 0 | 61060 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4779656 | 15 | 34324603 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 63682 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2684939 | 15 | 34326138 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 7.894e-7 | 0 | 65217 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201333500 | 15 | 34326639 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.46E-8 | 0 | 65718 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2684940 | 15 | 34327208 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 66287 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11638109 | 15 | 34327659 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 66738 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2339352 | 15 | 34327821 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 66900 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34150464 | 15 | 34328305 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 3.448e-7 | 0 | 67384 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS147715948 | 15 | 34328546 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.526E-8 | 0 | 67625 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35531038 | 15 | 34328853 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 67932 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS72109981 | 15 | 34329049 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.226E-7 | 0 | 68128 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11856633 | 15 | 34329327 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 68406 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4477671 | 15 | 34329673 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.522E-8 | 0 | 68752 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS112609265 | 15 | 34331290 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.528E-8 | 0 | 70369 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS398118727 | 15 | 34331580 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 4.462E-8 | 0 | 70659 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7168640 | 15 | 34332969 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 6.377E-8 | 0 | 72048 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34474029 | 15 | 34334604 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 4.384e-8 | 0 | 73683 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8030094 | 15 | 34336882 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 9.351E-8 | 0 | 75961 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4780203 | 15 | 34337671 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 9.351E-8 | 0 | 76750 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35804445 | 15 | 34339521 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 9.342e-8 | 0 | 78600 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS111293185 | 15 | 34345999 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.832E-7 | 0 | 85078 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62014671 | 15 | 34346918 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.832E-7 | 0 | 85997 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS71464844 | 15 | 34347123 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.832E-7 | 0 | 86202 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9707955 | 15 | 34347255 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 3.772E-7 | 0 | 86334 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8029344 | 15 | 34348972 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.089E-6 | 0 | 88051 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8035849 | 15 | 34350333 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.097E-6 | 0 | 89412 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8033781 | 15 | 34354739 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.446E-7 | 0 | 93818 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS112271785 | 15 | 34354772 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.192E-6 | 0 | 93851 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS541098 | 15 | 34358325 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.467E-7 | 0 | 97404 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62014673 | 15 | 34364207 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.467E-7 | 0 | 103286 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12917116 | 15 | 34364342 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.467E-7 | 0 | 103421 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8039219 | 15 | 34365093 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.533E-7 | 0 | 104172 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11634415 | 15 | 34367543 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.467E-7 | 0 | 106622 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2705338 | 15 | 34370487 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.382E-7 | 0 | 109566 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62014674 | 15 | 34373423 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.836E-7 | 0 | 112502 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS200233057 | 15 | 34374417 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.979E-7 | 0 | 113496 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS71119928 | 15 | 34374418 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.967E-7 | 0 | 113497 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4779657 | 15 | 34381087 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.851E-7 | 0 | 120166 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34448088 | 15 | 34384037 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 3.512E-7 | 0 | 123116 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2339373 | 15 | 34389558 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 9.825e-7 | 0 | 128637 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11634771 | 15 | 34390598 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.861E-7 | 0 | 129677 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11634610 | 15 | 34390890 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.861E-7 | 0 | 129969 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS199539204 | 15 | 34391113 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.861E-7 | 0 | 130192 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS71884335 | 15 | 34391115 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 2.859E-7 | 0 | 130194 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS17817764 | 15 | 34392120 | CHRM5 | ENSG00000184984.8 | 1.615E-6 | 0 | 131199 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Adarb1 | 0.89 | 0.89 |
| mgat3 | 0.88 | 0.94 |
| CYFIP2 | 0.88 | 0.88 |
| Nisch | 0.88 | 0.91 |
| SV2A | 0.87 | 0.89 |
| ZDHHC5 | 0.87 | 0.90 |
| AP1B1 | 0.87 | 0.89 |
| AP2A1 | 0.87 | 0.89 |
| TNFRSF21 | 0.87 | 0.88 |
| CNNM2 | 0.87 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.60 | -0.66 |
| AL139819.3 | -0.59 | -0.66 |
| AF347015.31 | -0.59 | -0.61 |
| GNG11 | -0.58 | -0.66 |
| higd1b | -0.58 | -0.62 |
| AP002478.3 | -0.57 | -0.64 |
| MT-CO2 | -0.57 | -0.60 |
| AF347015.2 | -0.57 | -0.54 |
| CLDN10 | -0.56 | -0.57 |
| AF347015.8 | -0.56 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0004981 | 毒蕈碱乙酰胆碱受体活性 | 塔斯 | 3272174 | |
| 去：0004435 | 磷酸肌醇磷脂酶C活性 | 塔斯 | 1905013 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0015872 | 多巴胺运输 | IEA | 神经递质，多巴胺（GO期限：8） | - |
| GO：0019226 | 神经冲动的传播 | IEA | 神经元（GO期限：5） | - |
| 去：0007197 | 毒蕈碱乙酰胆碱受体，腺苷酸环酶抑制途径 | 塔斯 | 8663391 | |
| 去：0007213 | 乙酰胆碱受体信号传导，毒蕈碱途径 | 塔斯 | 3272174 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0008283 | 细胞增殖 | 塔斯 | 8063729 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005886 | 质膜 | 塔斯 | 3272174 | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 3272174 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组胺配体结合受体 | 38 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |