基因页：CBX3
概括？
| 基因 | 11335 |
| 象征 | CBX3 |
| 同义词 | hech | hp1-gamma | hp1hs-gamma |
| 描述 | Chromobox 3 |
| 参考 | MIM：604477|HGNC：HGNC：1553|ENSEMBL：ENSG00000122565|HPRD：05130|Vega：Otthumg00000022911 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7p15.2 |
| Pascal P值 | 0.486 |
| Sherlock P值 | 0.964 |
| 胎儿β | 1.473 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17130231 | CHR1 | 88447325 | CBX3 | 11335 | 0.17 | 反式 | ||
| RS17370182 | Chr9 | 84461317 | CBX3 | 11335 | 0.11 | 反式 | ||
| RS12348077 | Chr9 | 138864087 | CBX3 | 11335 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| arl5a | arflp5 |arl5 | ADP-核糖基化因子样5A | 两个杂交 | Biogrid | 12414990 |
| CBX1 | CBX |hp1-beta |HP1HS-BETA |HP1HSBETA |M31 |mod1 |p25beta | Chromobox同源物1（HP1β同源果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 11336697 |
| CBX3 | Hech |HP1-gamma |HP1HS-GAMMA | Chromobox同源物3（HP1 Gamma同源物，果蝇） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11336697 |
| CBX5 | HP1 |HP1A | Chromobox同源物5（HP1 Alpha同源物，果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 11336697 |
| DNMT3B | ICF |M.Hsaiiib | DNA（胞嘧啶-5-） - 甲基转移酶3β | DNMT3B与HP1-gamma相互作用。这种相互作用是在小鼠DNMT3B1和人HP1-gamma之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15120635 |
| DSN1 | C20ORF172 |FLJ13346 |MGC32987 |MIS13 |DJ469A13.2 | DSN1，思维动物学复杂成分，同源物（S. cerevisiae） | C20ORF172与HP1-gamma相互作用。 | 绑定 | 15502821 |
| DSN1 | C20ORF172 |FLJ13346 |MGC32987 |MIS13 |DJ469A13.2 | DSN1，思维动物学复杂成分，同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 15502821 |
| lbr | DHCR14B |FLJ43126 |lmn2r |MGC9041 |PHA | 椎板B受体 | - | HPRD，Biogrid | 8663349 |
| MIS12 | 2510025F08RIK |kntc2ap |MGC2488 |mtw1 |HMIS12 | MIS12，思维动物学复杂成分，同源物（酵母） | - | HPRD，Biogrid | 15502821 |
| MIS12 | 2510025F08RIK |kntc2ap |MGC2488 |mtw1 |HMIS12 | MIS12，思维动物学复杂成分，同源物（酵母） | MIS12与HP1-gamma相互作用。 | 绑定 | 15502821 |
| MKI67 | 起亚|Ki-67 | 单克隆抗体KI-67鉴定的抗原 | PKI-67通过其C末端与HP1-gamma相互作用。这种相互作用是在人类和小鼠HP1-gamma之间的PKI-67之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 11793364 |
| MKI67 | 起亚|Ki-67 | 单克隆抗体KI-67鉴定的抗原 | - | HPRD，Biogrid | 12485163 |
| PIM1 | PIM | PIM-1癌基因 | - | HPRD，Biogrid | 10664448 |
| SP100 | DKFZP686E07254 |FLJ00340 |FLJ34579 | SP100核抗原 | - | HPRD，Biogrid | 9636147 |
| TRIM24 | PTC6 |RNF82 |TF1A |tif1 |tif1a |tif1alpha |HTIF1 | 三方基序24 | - | HPRD，Biogrid | 10562550 |
| Trim28 | FLJ29029 |kap1 |RNF96 |TF1B |tif1b | 三方基序28 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体外 体内 |
Biogrid | 10562550|11336697 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 6hr DN的Takeda目标 | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIZ红细胞分化HBZ | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bystroem与IL5 UP相关 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ferrando T与MLL融合一起 | 87 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedenfalk乳腺癌遗传与零星 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德斯癌元签名 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线响应集群D8 | 40 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BILD CTNNB1致癌特征 | 82 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sakai慢性肝炎与肝癌 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌ESR1的王转移 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |