基因页:exoc3
概括?
基因 | 11336 |
象征 | exoc3 |
同义词 | SEC6 | SEC6L1 | SEC6P |
描述 | 外囊复合物组件3 |
参考 | MIM:608186|HGNC:HGNC:30378|ENSEMBL:ENSG00000180104|HPRD:09738|Vega:Otthumg00000162205 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5p15.33 |
Pascal P值 | 0.634 |
Sherlock P值 | 0.142 |
胎儿β | 0.22 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 额叶皮质BA9 下丘脑 元 |
支持 | 胞吞作用 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG05479556 | 5 | 449004 | exoc3 | 4.72E-5 | 0.354 | 0.021 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS72711364 | 5 | 415323 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 2.108E-6 | 0 | -27950 | gtex_brain_ba24 |
RS6555242 | 5 | 416546 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.716E-6 | 0 | -26727 | gtex_brain_ba24 |
RS57433159 | 5 | 418725 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.709E-6 | 0 | -24548 | gtex_brain_ba24 |
RS72711368 | 5 | 418839 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.578E-6 | 0 | -24434 | gtex_brain_ba24 |
RS111713756 | 5 | 419318 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.417E-6 | 0 | -23955 | gtex_brain_ba24 |
RS146034618 | 5 | 420523 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.005E-6 | 0 | -22750 | gtex_brain_ba24 |
RS72711370 | 5 | 421057 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.096E-6 | 0 | -22216 | gtex_brain_ba24 |
RS11741946 | 5 | 421403 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 8.802E-7 | 0 | -21870 | gtex_brain_ba24 |
RS11741954 | 5 | 421455 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.028E-6 | 0 | -21818 | gtex_brain_ba24 |
RS10068732 | 5 | 421647 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 2.008e-9 | 0 | -21626 | gtex_brain_ba24 |
RS10072668 | 5 | 422752 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 5.072E-9 | 0 | -20521 | gtex_brain_ba24 |
RS9313065 | 5 | 423426 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 5.074E-9 | 0 | -19847 | gtex_brain_ba24 |
RS13360193 | 5 | 424463 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 2.601E-9 | 0 | -18810 | gtex_brain_ba24 |
RS13360218 | 5 | 424612 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 6.94e-9 | 0 | -18661 | gtex_brain_ba24 |
RS200261372 | 5 | 426541 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 3.986e-9 | 0 | -16732 | gtex_brain_ba24 |
RS12188321 | 5 | 428418 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 5.072E-9 | 0 | -14855 | gtex_brain_ba24 |
RS67665078 | 5 | 428754 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 5.072E-9 | 0 | -14519 | gtex_brain_ba24 |
RS957791 | 5 | 430217 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.062E-8 | 0 | -13056 | gtex_brain_ba24 |
RS768479 | 5 | 431196 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 3.03e-9 | 0 | -12077 | gtex_brain_ba24 |
RS11740891 | 5 | 435626 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 7.896E-10 | 0 | -7647 | gtex_brain_ba24 |
RS5865330 | 5 | 436387 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.837E-9 | 0 | -6886 | gtex_brain_ba24 |
RS72717425 | 5 | 438809 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 4.777E-7 | 0 | -4464 | gtex_brain_ba24 |
RS115554641 | 5 | 443236 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 6.732E-7 | 0 | -37 | gtex_brain_ba24 |
RS2721028 | 5 | 443849 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.248E-6 | 0 | 576 | gtex_brain_ba24 |
RS2037077 | 5 | 447226 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.23E-6 | 0 | 3953 | gtex_brain_ba24 |
RS2561663 | 5 | 459772 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.985E-6 | 0 | 16499 | gtex_brain_ba24 |
RS13356700 | 5 | 477719 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 2.331E-9 | 0 | 34446 | gtex_brain_ba24 |
RS562360175 | 5 | 478571 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 7.414e-7 | 0 | 35298 | gtex_brain_ba24 |
RS9885312 | 5 | 482186 | exoc3 | ENSG00000180104.11 | 1.601E-6 | 0 | 38913 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID胰岛素途径 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ARF6贩运途径 | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Ecadherin稳定途径 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素合成和加工 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN | 180 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌5p15 Amplicon | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1自分泌目标DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |