概括
基因 11336
象征 exoc3
同义词 SEC6 | SEC6L1 | SEC6P
描述 外囊复合物组件3
参考 MIM:608186|HGNC:HGNC:30378|ENSEMBL:ENSG00000180104|HPRD:09738|Vega:Otthumg00000162205
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5p15.33
Pascal P值 0.634
Sherlock P值 0.142
胎儿β 0.22
DMG 1(#研究)
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
额叶皮质BA9
下丘脑
支持 胞吞作用
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG05479556 5 449004 exoc3 4.72E-5 0.354 0.021 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS72711364 5 415323 exoc3 ENSG00000180104.11 2.108E-6 0 -27950 gtex_brain_ba24
RS6555242 5 416546 exoc3 ENSG00000180104.11 1.716E-6 0 -26727 gtex_brain_ba24
RS57433159 5 418725 exoc3 ENSG00000180104.11 1.709E-6 0 -24548 gtex_brain_ba24
RS72711368 5 418839 exoc3 ENSG00000180104.11 1.578E-6 0 -24434 gtex_brain_ba24
RS111713756 5 419318 exoc3 ENSG00000180104.11 1.417E-6 0 -23955 gtex_brain_ba24
RS146034618 5 420523 exoc3 ENSG00000180104.11 1.005E-6 0 -22750 gtex_brain_ba24
RS72711370 5 421057 exoc3 ENSG00000180104.11 1.096E-6 0 -22216 gtex_brain_ba24
RS11741946 5 421403 exoc3 ENSG00000180104.11 8.802E-7 0 -21870 gtex_brain_ba24
RS11741954 5 421455 exoc3 ENSG00000180104.11 1.028E-6 0 -21818 gtex_brain_ba24
RS10068732 5 421647 exoc3 ENSG00000180104.11 2.008e-9 0 -21626 gtex_brain_ba24
RS10072668 5 422752 exoc3 ENSG00000180104.11 5.072E-9 0 -20521 gtex_brain_ba24
RS9313065 5 423426 exoc3 ENSG00000180104.11 5.074E-9 0 -19847 gtex_brain_ba24
RS13360193 5 424463 exoc3 ENSG00000180104.11 2.601E-9 0 -18810 gtex_brain_ba24
RS13360218 5 424612 exoc3 ENSG00000180104.11 6.94e-9 0 -18661 gtex_brain_ba24
RS200261372 5 426541 exoc3 ENSG00000180104.11 3.986e-9 0 -16732 gtex_brain_ba24
RS12188321 5 428418 exoc3 ENSG00000180104.11 5.072E-9 0 -14855 gtex_brain_ba24
RS67665078 5 428754 exoc3 ENSG00000180104.11 5.072E-9 0 -14519 gtex_brain_ba24
RS957791 5 430217 exoc3 ENSG00000180104.11 1.062E-8 0 -13056 gtex_brain_ba24
RS768479 5 431196 exoc3 ENSG00000180104.11 3.03e-9 0 -12077 gtex_brain_ba24
RS11740891 5 435626 exoc3 ENSG00000180104.11 7.896E-10 0 -7647 gtex_brain_ba24
RS5865330 5 436387 exoc3 ENSG00000180104.11 1.837E-9 0 -6886 gtex_brain_ba24
RS72717425 5 438809 exoc3 ENSG00000180104.11 4.777E-7 0 -4464 gtex_brain_ba24
RS115554641 5 443236 exoc3 ENSG00000180104.11 6.732E-7 0 -37 gtex_brain_ba24
RS2721028 5 443849 exoc3 ENSG00000180104.11 1.248E-6 0 576 gtex_brain_ba24
RS2037077 5 447226 exoc3 ENSG00000180104.11 1.23E-6 0 3953 gtex_brain_ba24
RS2561663 5 459772 exoc3 ENSG00000180104.11 1.985E-6 0 16499 gtex_brain_ba24
RS13356700 5 477719 exoc3 ENSG00000180104.11 2.331E-9 0 34446 gtex_brain_ba24
RS562360175 5 478571 exoc3 ENSG00000180104.11 7.414e-7 0 35298 gtex_brain_ba24
RS9885312 5 482186 exoc3 ENSG00000180104.11 1.601E-6 0 38913 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID胰岛素途径 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6贩运途径 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Ecadherin稳定途径 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素合成和加工 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌5p15 Amplicon 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因