基因页：SCRG1
概括？
| 基因 | 11341 |
| 象征 | SCRG1 |
| 同义词 | SCRG-1 |
| 描述 | 软骨发生1 |
| 参考 | MIM：603163|HGNC：HGNC：17036|HPRD：11932| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q34.1 |
| Pascal P值 | 0.125 |
| Sherlock P值 | 0.895 |
| 胎儿β | -2.592 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2086477 | CHR4 | 174347474 | SCRG1 | 11341 | 0.05 | 顺式 | ||
| RS57194400 | 4 | 174313967 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.305E-6 | 0 | 13564 | gtex_brain_ba24 |
| RS56372412 | 4 | 174314076 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 9.941E-7 | 0 | 13455 | gtex_brain_ba24 |
| RS17259430 | 4 | 174314494 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.452E-6 | 0 | 13037 | gtex_brain_ba24 |
| RS398083774 | 4 | 174314855 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.286E-6 | 0 | 12676 | gtex_brain_ba24 |
| RS2086476 | 4 | 174315768 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 2.122E-6 | 0 | 11763 | gtex_brain_ba24 |
| RS576586586 | 4 | 174315810 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.307E-7 | 0 | 11721 | gtex_brain_ba24 |
| RS2101092 | 4 | 174315913 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.249E-6 | 0 | 11618 | gtex_brain_ba24 |
| RS35746517 | 4 | 174316173 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.293E-6 | 0 | 11358 | gtex_brain_ba24 |
| RS34803696 | 4 | 174318104 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 5.9E-8 | 0 | 9427 | gtex_brain_ba24 |
| RS4696069 | 4 | 174323055 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.453E-8 | 0 | 4476 | gtex_brain_ba24 |
| RS17325472 | 4 | 174323131 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 9.52e-8 | 0 | 4400 | gtex_brain_ba24 |
| RS13148735 | 4 | 174323228 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 4.043E-7 | 0 | 4303 | gtex_brain_ba24 |
| RS6827729 | 4 | 174323259 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 5.197E-7 | 0 | 4272 | gtex_brain_ba24 |
| RS17259664 | 4 | 174324624 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 3.014e-7 | 0 | 2907 | gtex_brain_ba24 |
| RS4696071 | 4 | 174325726 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 2.726E-8 | 0 | 1805年 | gtex_brain_ba24 |
| RS4696072 | 4 | 174326283 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 3.077E-8 | 0 | 1248 | gtex_brain_ba24 |
| RS7655786 | 4 | 174327618 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 3.589E-8 | 0 | -87 | gtex_brain_ba24 |
| RS1992466 | 4 | 174330663 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 3.638E-9 | 0 | -3132 | gtex_brain_ba24 |
| RS9996723 | 4 | 174331387 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 3.68e-9 | 0 | -3856 | gtex_brain_ba24 |
| RS4695836 | 4 | 174331821 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 3.705E-9 | 0 | -4290 | gtex_brain_ba24 |
| RS13128793 | 4 | 174332612 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 5.607E-8 | 0 | -5081 | gtex_brain_ba24 |
| RS397763068 | 4 | 174332966 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 2.171E-7 | 0 | -5435 | gtex_brain_ba24 |
| RS7436467 | 4 | 174334864 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 5.607E-8 | 0 | -7333 | gtex_brain_ba24 |
| RS7656222 | 4 | 174335738 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 5.696E-8 | 0 | -8207 | gtex_brain_ba24 |
| RS6846432 | 4 | 174339165 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 9.006e-7 | 0 | -11634 | gtex_brain_ba24 |
| RS7658420 | 4 | 174345788 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.244E-6 | 0 | -18257 | gtex_brain_ba24 |
| RS1481121 | 4 | 174348397 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.196E-6 | 0 | -20866 | gtex_brain_ba24 |
| RS7655786 | 4 | 174327618 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.122E-6 | 0.01 | -87 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1992466 | 4 | 174330663 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 2.786E-6 | 0.01 | -3132 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9996723 | 4 | 174331387 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 2.803E-6 | 0.01 | -3856 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4695836 | 4 | 174331821 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 2.803E-6 | 0.01 | -4290 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6846432 | 4 | 174339165 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 4.73E-6 | 0.01 | -11634 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13121541 | 4 | 174344196 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 5.883e-7 | 0.01 | -16665 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201411208 | 4 | 174344816 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 1.069E-6 | 0.01 | -17285 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7658420 | 4 | 174345788 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 4.733E-6 | 0.01 | -18257 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1481121 | 4 | 174348397 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 4.735E-6 | 0.01 | -20866 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4146857 | 4 | 174349920 | SCRG1 | ENSG00000164106.3 | 7.791E-7 | 0.01 | -22389 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 9660755 |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 9660755 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane乳腺癌ESR1 DN | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee神经Crest干细胞向上 | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chebotaev gr目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤UP | 35 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 克拉斯的iwanaga致癌作用 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 大脑中的Smid乳腺癌复发 | 39 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WU被膀胱癌中的甲基化沉默 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen Gist vs滑膜肉瘤DN | 20 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |