基因页：chrna2
概括？
| 基因 | 1135 |
| 象征 | chrna2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 胆碱能受体烟碱α2亚基 |
| 参考 | MIM：118502|HGNC：HGNC：1956|Ensembl：ENSG00000120903|HPRD：00332|Vega：Otthumg00000102083 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p21 |
| Pascal P值 | 0.004 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.00057 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.03086 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG15744111 | 8 | 27336890 | chrna2 | 7.82e-5 | -0.389 | 0.025 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC005544.1 | 0.86 | 0.85 |
| CACNG4 | 0.86 | 0.86 |
| FGD1 | 0.85 | 0.88 |
| Cul7 | 0.84 | 0.86 |
| HCN3 | 0.84 | 0.88 |
| IFT140 | 0.84 | 0.85 |
| plekhg4b | 0.84 | 0.86 |
| rec8 | 0.83 | 0.85 |
| UBAP2 | 0.83 | 0.85 |
| C17orf70 | 0.83 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.65 | -0.76 |
| HLA-F | -0.64 | -0.74 |
| AIFM3 | -0.62 | -0.72 |
| S100B | -0.62 | -0.78 |
| CA4 | -0.62 | -0.72 |
| aldoc | -0.62 | -0.67 |
| AF347015.27 | -0.61 | -0.80 |
| AF347015.31 | -0.61 | -0.79 |
| pth1r | -0.61 | -0.69 |
| CSRP1 | -0.61 | -0.72 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0015464 | 乙酰胆碱受体活性 | 艾达 | 神经递质（GO期限：6） | 8906617 |
| 去：0004889 | 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 | 艾达 | 8906617 | |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| 去：0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007165 | 信号转导 | 艾达 | 8906617 | |
| 去：0006811 | 离子运输 | nas | 8906617 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005892 | 烟碱乙酰胆碱门控受体通道复合物 | 艾达 | 神经递质（GO期限：9） | 8906617 |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | nas | 8906617 | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组乙酰胆碱结合和下游事件 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome高度钙可渗透的突触后烟碱乙酰胆碱受体 | 13 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组突触前烟碱乙酰胆碱受体 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McCabe Hoxc6靶向 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |