基因页：PIK3IP1
Summary？
| GeneID | 113791 |
| 象征 | PIK3IP1 |
| 同义词 | HGFL | HHGFL（S） |
| 描述 | 磷酸肌醇-3-激酶相互作用蛋白1 |
| 参考 | HGNC：HGNC：24942|Ensembl：ENSG00000100100|HPRD:17518|Vega：Otthumg00000151256 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q12.2 |
| Pascal P值 | 0.016 |
| Sherlock P值 | 0.017 |
| 胎儿β | -0.816 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG20988728 | 22 | 31688502 | PIK3IP1 | 6.89E-8 | -0.013 | 1.68e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11119635 | CHR1 | 211116401 | PIK3IP1 | 113791 | 0.2 | 反式 | ||
| RS16833615 | CHR2 | 154414433 | PIK3IP1 | 113791 | 0.19 | 反式 | ||
| RS2398646 | CHR5 | 3844765 | PIK3IP1 | 113791 | 0.09 | 反式 | ||
| rs3908707 | Chr10 | 32022345 | PIK3IP1 | 113791 | 0.12 | 反式 | ||
| RS16964720 | CHR15 | 52351912 | PIK3IP1 | 113791 | 0.18 | 反式 | ||
| RS36471 | CHR16 | 46783988 | PIK3IP1 | 113791 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 1415 | 1421 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| mir-124/506 | 590 | 596 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-130/301 | 657 | 663 | M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-132/212 | 394 | 400 | 1a | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
| HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
| mir-199 | 30 | 36 | M8 | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
| HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
| mir-410 | 1410 | 1416 | 1a | HSA-MIR-410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir-539 | 1391 | 1397 | M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |