基因页：SLC35A4
概括？
| 基因 | 113829 |
| 象征 | SLC35A4 |
| 同义词 | - |
| 描述 | Solute Carrier家族35成员A4 |
| 参考 | HGNC：HGNC：20753|ENSEMBL：ENSG00000176087|HPRD：11574|Vega：Otthumg00000129495 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q31.3 |
| Pascal P值 | 3.229E-4 |
| Sherlock P值 | 0.269 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG27337021 | 5 | 139947627 | SLC35A4 | 5.487E-4 | 0.305 | 0.049 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005351 | 糖：氢分类者活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008643 | 碳水化合物运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ozen mir125b1靶标 | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 105 | 111 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-125/351 | 651 | 658 | 1A，M8 | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
| HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
| mir-137 | 897 | 904 | 1A，M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-143 | 647 | 654 | 1A，M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
| mir-490 | 140 | 147 | 1A，M8 | HSA-MIR-490 | caaccuggaggacuaugcugcug |