概括
基因 1139
象征 chrna7
同义词 CHRNA7-2 | NACHRA7
描述 胆碱能受体烟碱α7亚基
参考 MIM:118511|HGNC:HGNC:1960|ENSEMBL:ENSG00000175344|HPRD:00339|Vega:Otthumg00000129285
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q14
Pascal P值 0.133
胎儿β 0.528
支持 配体门控离子信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:6
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:31

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA0196 0.87 0.85
Trip12 0.87 0.87
MTMR15 0.86 0.86
IPO8 0.86 0.85
KIAA1012 0.85 0.86
FAM178A 0.85 0.86
NBR1 0.85 0.84
PTK2 0.85 0.83
UTP14C 0.84 0.86
RBBP5 0.84 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.67 -0.64
ifi27 -0.64 -0.67
IL32 -0.62 -0.61
MT-CO2 -0.62 -0.62
FXYD1 -0.61 -0.63
higd1b -0.60 -0.63
VAMP5 -0.60 -0.60
AF347015.31 -0.59 -0.62
CXCL14 -0.59 -0.63
CSAG1 -0.59 -0.59

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030594 神经递质受体活性 IEA 神经递质(GO期限:5) -
GO:0015464 乙酰胆碱受体活性 艾达 神经递质(GO期限:6) 8906617
去:0001540 β-淀粉样蛋白结合 IPI 10681545
去:0004889 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 艾达 8145738|8906617
去:0004889 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005216 离子通道活动 IEA -
去:0005230 细胞外配体门控离子通道活性 IEA -
GO:0015643 毒素结合 艾达 12508119
GO:0017081 氯化物通道调节剂活性 艾达 8145738
GO:0042803 蛋白质同构化活性 艾达 8145738
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007271 突触传播,胆碱能 IEA 神经元,胆碱能,突触,神经递质(GO期限:7) -
GO:0032225 调节突触传播,多巴胺能的调节 IEA 神经元,突触,神经递质,多巴胺(GO期限:9) -
GO:0000187 MAPK活动的激活 艾达 10771023
去:0001666 对缺氧的反应 艾达 12189247
去:0001988 压力感受器对系统性动脉血压降低的心脏速率的正调控 IEA -
去:0007165 信号转导 艾达 8906617
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 小鬼 16280133|17498763
去:0008306 协会学习 IEA -
去:0007613 记忆 IEA -
去:0007613 记忆 nas 10681545
去:0006816 钙离子传输 艾达 8145738
去:0006816 钙离子传输 小鬼 10771023
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0006811 离子运输 nas 8906617
去:0006897 内吞作用 IEA -
去:0006874 细胞钙离子稳态 小鬼 16280133
GO:0014061 去甲肾上腺素分泌的调节 IEA -
GO:0042391 调节膜电位 IEA -
去:0032094 对食物的反应 IEA -
去:0042698 排卵周期 IEA -
GO:0042113 B细胞激活 IEA -
GO:0042110 T细胞激活 IEA -
GO:0032720 肿瘤坏死因子产生的负调控 IEA -
GO:0032720 肿瘤坏死因子产生的负调控 小鬼 12508119
GO:0032715 白介素6产生的负调节 IEA -
GO:0032691 白介素-1β产生的负调节 IEA -
去:0030317 精子运动 IEA -
GO:0035095 对尼古丁的行为反应 IEA -
GO:0045766 血管生成的阳性调控 小鬼 12189247|16280133
GO:0048149 对乙醇的行为反应 IEA -
GO:0050728 炎症反应的负调节 艾达 12508119
GO:0050728 炎症反应的负调节 IEA -
GO:0060112 产生排卵周期节奏 IEA -
GO:0050890 认识 小鬼 16754836
GO:0050890 认识 nas 10681545
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005892 烟碱乙酰胆碱门控受体通道复合物 艾达 神经递质(GO期限:9) 8906617
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005624 膜分数 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 nas 8145738|8906617
去:0009897 质膜的外侧 IEA -
去:0005886 质膜 艾达 16280133
GO:0016324 顶质膜 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组乙酰胆碱结合和下游事件 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome高度钙可渗透的突触后烟碱乙酰胆碱受体 13 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA受伽马辐射损伤 81 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向DN 97 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因