基因页:chrna7
概括?
基因 | 1139 |
象征 | chrna7 |
同义词 | CHRNA7-2 | NACHRA7 |
描述 | 胆碱能受体烟碱α7亚基 |
参考 | MIM:118511|HGNC:HGNC:1960|ENSEMBL:ENSG00000175344|HPRD:00339|Vega:Otthumg00000129285 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q14 |
Pascal P值 | 0.133 |
胎儿β | 0.528 |
支持 | 配体门控离子信号传导 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:6 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:31 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CHRNA7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA0196 | 0.87 | 0.85 |
Trip12 | 0.87 | 0.87 |
MTMR15 | 0.86 | 0.86 |
IPO8 | 0.86 | 0.85 |
KIAA1012 | 0.85 | 0.86 |
FAM178A | 0.85 | 0.86 |
NBR1 | 0.85 | 0.84 |
PTK2 | 0.85 | 0.83 |
UTP14C | 0.84 | 0.86 |
RBBP5 | 0.84 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.67 | -0.64 |
ifi27 | -0.64 | -0.67 |
IL32 | -0.62 | -0.61 |
MT-CO2 | -0.62 | -0.62 |
FXYD1 | -0.61 | -0.63 |
higd1b | -0.60 | -0.63 |
VAMP5 | -0.60 | -0.60 |
AF347015.31 | -0.59 | -0.62 |
CXCL14 | -0.59 | -0.63 |
CSAG1 | -0.59 | -0.59 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0030594 | 神经递质受体活性 | IEA | 神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0015464 | 乙酰胆碱受体活性 | 艾达 | 神经递质(GO期限:6) | 8906617 |
去:0001540 | β-淀粉样蛋白结合 | IPI | 10681545 | |
去:0004889 | 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 | 艾达 | 8145738|8906617 | |
去:0004889 | 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
去:0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
GO:0015643 | 毒素结合 | 艾达 | 12508119 | |
GO:0017081 | 氯化物通道调节剂活性 | 艾达 | 8145738 | |
GO:0042803 | 蛋白质同构化活性 | 艾达 | 8145738 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007271 | 突触传播,胆碱能 | IEA | 神经元,胆碱能,突触,神经递质(GO期限:7) | - |
GO:0032225 | 调节突触传播,多巴胺能的调节 | IEA | 神经元,突触,神经递质,多巴胺(GO期限:9) | - |
GO:0000187 | MAPK活动的激活 | 艾达 | 10771023 | |
去:0001666 | 对缺氧的反应 | 艾达 | 12189247 | |
去:0001988 | 压力感受器对系统性动脉血压降低的心脏速率的正调控 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | 艾达 | 8906617 | |
去:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 小鬼 | 16280133|17498763 | |
去:0008306 | 协会学习 | IEA | - | |
去:0007613 | 记忆 | IEA | - | |
去:0007613 | 记忆 | nas | 10681545 | |
去:0006816 | 钙离子传输 | 艾达 | 8145738 | |
去:0006816 | 钙离子传输 | 小鬼 | 10771023 | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
去:0006811 | 离子运输 | nas | 8906617 | |
去:0006897 | 内吞作用 | IEA | - | |
去:0006874 | 细胞钙离子稳态 | 小鬼 | 16280133 | |
GO:0014061 | 去甲肾上腺素分泌的调节 | IEA | - | |
GO:0042391 | 调节膜电位 | IEA | - | |
去:0032094 | 对食物的反应 | IEA | - | |
去:0042698 | 排卵周期 | IEA | - | |
GO:0042113 | B细胞激活 | IEA | - | |
GO:0042110 | T细胞激活 | IEA | - | |
GO:0032720 | 肿瘤坏死因子产生的负调控 | IEA | - | |
GO:0032720 | 肿瘤坏死因子产生的负调控 | 小鬼 | 12508119 | |
GO:0032715 | 白介素6产生的负调节 | IEA | - | |
GO:0032691 | 白介素-1β产生的负调节 | IEA | - | |
去:0030317 | 精子运动 | IEA | - | |
GO:0035095 | 对尼古丁的行为反应 | IEA | - | |
GO:0045766 | 血管生成的阳性调控 | 小鬼 | 12189247|16280133 | |
GO:0048149 | 对乙醇的行为反应 | IEA | - | |
GO:0050728 | 炎症反应的负调节 | 艾达 | 12508119 | |
GO:0050728 | 炎症反应的负调节 | IEA | - | |
GO:0060112 | 产生排卵周期节奏 | IEA | - | |
GO:0050890 | 认识 | 小鬼 | 16754836 | |
GO:0050890 | 认识 | nas | 10681545 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005892 | 烟碱乙酰胆碱门控受体通道复合物 | 艾达 | 神经递质(GO期限:9) | 8906617 |
GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
去:0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | nas | 8145738|8906617 | |
去:0009897 | 质膜的外侧 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 16280133 | |
GO:0016324 | 顶质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组乙酰胆碱结合和下游事件 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome高度钙可渗透的突触后烟碱乙酰胆碱受体 | 13 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA受伽马辐射损伤 | 81 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe Wnt3a靶向DN | 97 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |