基因页：CHRNB2

概括？
基因 1141
象征 CHRNB2
同义词 efnl3 | nachrb2
描述 胆碱能受体烟碱β2亚基
参考 MIM：118507|HGNC：HGNC：1962|ENSEMBL：ENSG00000160716|HPRD：00335|Vega：Otthumg0000000037262
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.3
胎儿β 0.009
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
支持 配体门控离子信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字：11

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG17887936 1 154540354 CHRNB2 2.7E-8 -0.014 8.55e-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SSBP3 0.73 0.75
Sorcs1 0.70 0.71
KLHL32 0.70 0.67
nxph3 0.69 0.62
EMX1 0.68 0.75
AC127496.3 0.65 0.64
提亚姆2 0.65 0.69
HS3ST4 0.65 0.67
RGS6 0.63 0.66
RP1-21O18.1 0.63 0.66
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CCDC80 -0.48 -0.61
Rhoc -0.48 -0.57
S100A16 -0.46 -0.55
TMEM51 -0.46 -0.54
BDH2 -0.45 -0.52
apoe -0.45 -0.55
NMI -0.45 -0.53
DBI -0.45 -0.56
HSD17B14 -0.45 -0.51
serpinb6 -0.45 -0.48

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015464 乙酰胆碱受体活性 艾达 神经递质（GO期限：6） 8906617
去：0004889 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 艾达 8906617
去：0005515 蛋白质结合 ISS -
去：0005216 离子通道活动 IEA -
去：0005230 细胞外配体门控离子通道活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0060084 排尿涉及的突触传输 ISS 神经元，突触（GO期限：8） -
GO：0051963 突触发生的调节 ISS 突触（GO期限：9） -
GO：0021631 视神经形态发生 ISS 大脑（GO期限：9） -
GO：0032226 突触传播，多巴胺能的阳性调节 IEA 神经元，突触，神经递质，多巴胺（GO期限：10） -
GO：0021952 中枢神经系统投影神经元轴突发生 ISS 神经元，轴突（GO术语级别：14） -
GO：0033603 多巴胺分泌的阳性调节 ISS 多巴胺（GO期限：11） -
GO：0042053 多巴胺代谢过程的调节 ISS 多巴胺（GO期限：9） -
GO：0048814 树突形态发生的调节 ISS 树突（GO期限：13） -
去：0001666 对缺氧的反应 艾达 12189247
去：0001661 条件味道厌恶 IEA -
去：0007165 信号转导 艾达 8906617
去：0008542 视觉学习 小鬼 15964197
去：0007626 运动行为 ISS -
去：0007613 记忆 小鬼 15964197
去：0007605 声音的感官感知 ISS -
去：0007601 视觉感知 ISS -
去：0006816 钙离子传输 ISS -
去：0006811 离子运输 nas 8906617
去：0006939 平滑肌收缩 ISS -
GO：0042220 对可卡因的反应 ISS -
去：0042320 调节昼夜节律睡眠/唤醒周期，REM睡眠 ISS -
GO：0021562 前庭神经发育 ISS -
GO：0042113 B细胞激活 ISS -
GO：0030890 B细胞增殖的阳性调节 ISS -
GO：0019233 疼痛的感觉感知 ISS -
GO：0021771 侧向核发育 ISS -
GO：0035176 社会行为 ISS -
GO：0035095 对尼古丁的行为反应 小鬼 17559419
GO：0045759 动作潜力的负调节 ISS -
GO：0045188 调节昼夜节律/唤醒周期，非REM睡眠 IEA -
GO：0045471 对乙醇的反应 ISS -
GO：0050890 认识 小鬼 17559419
GO：0051899 膜去极化 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005892 烟碱乙酰胆碱门控受体通道复合物 艾达 神经递质（GO期限：9） 8906617
GO：0045211 突触后膜 IEA 突触，神经递质（GO期限：5） -
GO：0045202 突触 IEA 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） -
GO：0016021 膜不可或缺 nas 8906617
去：0009897 质膜的外侧 ISS -
去：0005886 质膜 IEA -
GO：0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组乙酰胆碱结合和下游事件 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome高度钙可渗透的突触后烟碱乙酰胆碱受体 13 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组突触前烟碱乙酰胆碱受体 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因