基因页:CHRNB3
概括?
基因 | 1142 |
象征 | CHRNB3 |
同义词 | - |
描述 | 胆碱能受体烟碱β3亚基 |
参考 | MIM:118508|HGNC:HGNC:1963|ENSEMBL:ENSG00000147432|HPRD:00336|Vega:Otthumg00000165262 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p11.2 |
Pascal P值 | 0.046 |
胎儿β | -0.678 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | CHRNB3 | 1142 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CHRNB3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0030594 | 神经递质受体活性 | IEA | 神经递质(GO期限:5) | - |
去:0004889 | 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 | 塔斯 | 7690916 | |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
去:0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
GO:0015267 | 通道活动 | 塔斯 | 7690916 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007271 | 突触传播,胆碱能 | 塔斯 | 神经元,胆碱能,突触,神经递质(GO期限:7) | 7690916 |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 7690916 | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005892 | 烟碱乙酰胆碱门控受体通道复合物 | 塔斯 | 神经递质(GO期限:9) | 7690916 |
GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | nas | 8906617 | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组乙酰胆碱结合和下游事件 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome高度钙可渗透的突触后烟碱乙酰胆碱受体 | 13 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组突触前烟碱乙酰胆碱受体 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8p12 P11扩增子 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |