概括
基因 1142
象征 CHRNB3
同义词 -
描述 胆碱能受体烟碱β3亚基
参考 MIM:118508|HGNC:HGNC:1963|ENSEMBL:ENSG00000147432|HPRD:00336|Vega:Otthumg00000165262
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p11.2
Pascal P值 0.046
胎儿β -0.678
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:4

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 CHRNB3 1142 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030594 神经递质受体活性 IEA 神经递质(GO期限:5) -
去:0004889 烟碱乙酰胆碱激活的阳离子选择通道活性 塔斯 7690916
去:0005216 离子通道活动 IEA -
去:0005230 细胞外配体门控离子通道活性 IEA -
GO:0015267 通道活动 塔斯 7690916
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007271 突触传播,胆碱能 塔斯 神经元,胆碱能,突触,神经递质(GO期限:7) 7690916
去:0007165 信号转导 塔斯 7690916
去:0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005892 烟碱乙酰胆碱门控受体通道复合物 塔斯 神经递质(GO期限:9) 7690916
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
GO:0016021 膜不可或缺 nas 8906617
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组乙酰胆碱结合和下游事件 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome高度钙可渗透的突触后烟碱乙酰胆碱受体 13 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组突触前烟碱乙酰胆碱受体 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8p12 P11扩增子 57 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因