概括
基因 114571
象征 SLC22A9
同义词 hoat4 | oat4 | oat7 | ust3h | ust3
描述 Solute Carrier家族22成员9
参考 MIM:607579|HGNC:HGNC:16261|ENSEMBL:ENSG00000149742|HPRD:06982|Vega:Otthumg00000167805
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13.1
Pascal P值 0.972
胎儿β -0.39
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DNM:Guipponi_2014 整个外显子组测序分析 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
SLC22A9 t 一个 NM_080866 P.S143T 错过 0.18 0.02 精神分裂症 DNM:Guipponi_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7141453 CHR14 55047948 SLC22A9 114571 0.16 反式
RS17646919 CHR22 30400860 SLC22A9 114571 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D DN 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因