基因页:SLC22A9
概括?
基因 | 114571 |
象征 | SLC22A9 |
同义词 | hoat4 | oat4 | oat7 | ust3h | ust3 |
描述 | Solute Carrier家族22成员9 |
参考 | MIM:607579|HGNC:HGNC:16261|ENSEMBL:ENSG00000149742|HPRD:06982|Vega:Otthumg00000167805 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13.1 |
Pascal P值 | 0.972 |
胎儿β | -0.39 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DNM:Guipponi_2014 | 整个外显子组测序分析 | 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SLC22A9 | t | 一个 | NM_080866 | P.S143T | 错过 | 0.18 | 0.02 | 精神分裂症 | DNM:Guipponi_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7141453 | CHR14 | 55047948 | SLC22A9 | 114571 | 0.16 | 反式 | ||
RS17646919 | CHR22 | 30400860 | SLC22A9 | 114571 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC22A9_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病35D DN | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |