基因页:tirap
概括?
基因 | 114609 |
象征 | tirap |
同义词 | bacts1 | mal | myd88-2 |怀亚特 |
描述 | Toll-Interleukin 1受体(TIR)结构域含有衔接蛋白 |
参考 | MIM:606252|HGNC:HGNC:17192|Ensembl:ENSG00000150455|Vega:Otthumg00000140373 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q24.2 |
Pascal P值 | 0.021 |
胎儿β | -0.937 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 皮质 额叶皮质BA9 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15932284 | 11 | 126153561 | tirap | 2.834e-4 | 0.432 | 0.039 | DMG:Wockner_2014 |
CG13986503 | 11 | 126152983 | tirap | 3.951E-4 | -0.168 | 0.043 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS574198 | 11 | 126069841 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.849E-6 | 0.01 | -83119 | gtex_brain_ba24 |
RS587891 | 11 | 126081336 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -71624 | gtex_brain_ba24 |
RS633607 | 11 | 126086768 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -66192 | gtex_brain_ba24 |
RS12293354 | 11 | 126093098 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -59862 | gtex_brain_ba24 |
RS10790794 | 11 | 126093217 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -59743 | gtex_brain_ba24 |
RS10893488 | 11 | 126095747 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -57213 | gtex_brain_ba24 |
RS675412 | 11 | 126103368 | tirap | ENSG00000150455.9 | 2.143E-7 | 0.01 | -49592 | gtex_brain_ba24 |
RS1815820 | 11 | 126111520 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -41440 | gtex_brain_ba24 |
RS642137 | 11 | 126114630 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -38330 | gtex_brain_ba24 |
RS685409 | 11 | 126130232 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.602E-6 | 0.01 | -22728 | gtex_brain_ba24 |
RS609634 | 11 | 126163124 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.501E-6 | 0.01 | 10164 | gtex_brain_ba24 |
RS625413 | 11 | 126164349 | tirap | ENSG00000150455.9 | 6.669E-7 | 0.01 | 11389 | gtex_brain_ba24 |
RS682991 | 11 | 126167696 | tirap | ENSG00000150455.9 | 6.5e-7 | 0.01 | 14736 | gtex_brain_ba24 |
RS2962116 | 11 | 126169009 | tirap | ENSG00000150455.9 | 1.373E-6 | 0.01 | 16049 | gtex_brain_ba24 |
RS603758 | 11 | 126203737 | tirap | ENSG00000150455.9 | 2.093E-6 | 0.01 | 50777 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TIRAP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta GSK3途径 | 27 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta收费途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TOLL内源性途径 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori前BI淋巴细胞DN | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath免疫记忆 | 65 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ouyang前列腺癌的进展 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼(Hoffmann | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |