概括
基因 114609
象征 tirap
同义词 bacts1 | mal | myd88-2 |怀亚特
描述 Toll-Interleukin 1受体(TIR)结构域含有衔接蛋白
参考 MIM:606252|HGNC:HGNC:17192|Ensembl:ENSG00000150455|Vega:Otthumg00000140373
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q24.2
Pascal P值 0.021
胎儿β -0.937
DMG 1(#研究)
主持人 前扣带回皮层BA24
皮质
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15932284 11 126153561 tirap 2.834e-4 0.432 0.039 DMG:Wockner_2014
CG13986503 11 126152983 tirap 3.951E-4 -0.168 0.043 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS574198 11 126069841 tirap ENSG00000150455.9 1.849E-6 0.01 -83119 gtex_brain_ba24
RS587891 11 126081336 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -71624 gtex_brain_ba24
RS633607 11 126086768 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -66192 gtex_brain_ba24
RS12293354 11 126093098 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -59862 gtex_brain_ba24
RS10790794 11 126093217 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -59743 gtex_brain_ba24
RS10893488 11 126095747 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -57213 gtex_brain_ba24
RS675412 11 126103368 tirap ENSG00000150455.9 2.143E-7 0.01 -49592 gtex_brain_ba24
RS1815820 11 126111520 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -41440 gtex_brain_ba24
RS642137 11 126114630 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -38330 gtex_brain_ba24
RS685409 11 126130232 tirap ENSG00000150455.9 1.602E-6 0.01 -22728 gtex_brain_ba24
RS609634 11 126163124 tirap ENSG00000150455.9 1.501E-6 0.01 10164 gtex_brain_ba24
RS625413 11 126164349 tirap ENSG00000150455.9 6.669E-7 0.01 11389 gtex_brain_ba24
RS682991 11 126167696 tirap ENSG00000150455.9 6.5e-7 0.01 14736 gtex_brain_ba24
RS2962116 11 126169009 tirap ENSG00000150455.9 1.373E-6 0.01 16049 gtex_brain_ba24
RS603758 11 126203737 tirap ENSG00000150455.9 2.093E-6 0.01 50777 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta GSK3途径 27 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta收费途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TOLL内源性途径 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞DN 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath免疫记忆 65 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouyang前列腺癌的进展 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼(Hoffmann 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因