基因页：XKR4

概括？
基因 114786
象征 XKR4
同义词 XRG4
描述 XK相关4
参考 HGNC：HGNC：29394|HPRD：17228|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q12.1
Pascal P值 0.123
Sherlock P值 0.093
胎儿beta 0.561

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
PMID：COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

细胞成分 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃SZGR 2.0途径中的基因 信息
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-129-5p 804 810 M8 HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcggugggcuugcu
mir-153 712 718 M8 HSA-MIR-153 uugcauagucacaaaaguga
mir-155 1420 1426 1a HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-182 1022 1028 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucacaca
mir-192/215 1162 1168 1a HSA-MIR-192 cugaccuaugaauugacagcc
HSA-MIR-215 Augaccuaugaauugacagac
mir-208 1857年 1863年 1a HSA-MIR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-29 1713年 1719年 1a HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-370 46 52 M8 HSA-MIR-370脑 gccugggggguggaaccugg
mir-450 804 810 1a HSA-MIR-450 uuuuugcgauguuccuaaua
mir-496 766 772 1a HSA-MIR-496 auacaugggccaaucuc
mir-499 1857年 1863年 1a HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa
mir-96 1021 1028 1A，M8 HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc