基因页面:CCDC85A
总结吗?
GeneID | 114800年 |
象征 | CCDC85A |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 卷曲螺旋域包含85 |
参考 | HGNC: HGNC: 29400|运用:ENSG00000055813|织女:OTTHUMG00000152033 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2 p16.1 |
帕斯卡假定值 | 0.001 |
夏洛克假定值 | 0.223 |
eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs201842945 | 2 | 56635587 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 3.8575 e-6 | 0.02 | 224329年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12620094 | 2 | 56659492 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 3.8535 e-6 | 0.02 | 248234年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13414331 | 2 | 56662467 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 4.15871 e-6 | 0.02 | 251209年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs79330727 | 2 | 56712638 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 1.23452 e-6 | 0.02 | 301380年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2033014 | 2 | 56713056 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 3.05021 e-6 | 0.02 | 301798年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1304411 | 2 | 56715146 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 1.79325 e-6 | 0.02 | 303888年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs397868767 | 2 | 56719790 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 1.41061 e-6 | 0.02 | 308532年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11678015 | 2 | 56757010 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 2.17218 e-6 | 0.02 | 345752年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1304899 | 2 | 56759863 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 3.51132 e-6 | 0.02 | 348605年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1304897 | 2 | 56760001 | CCDC85A | ENSG00000055813.5 | 3.1327 e-6 | 0.02 | 348743年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CCDC85A_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
加里CD5 DN的目标 | 431年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
詹多发性骨髓瘤惠普 | 49 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 142年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
COULOUARN颞TGFB1签名DN | 138年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 210年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群7 | 118年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |