基因页：galnt13
概括？
| 基因 | 114805 |
| 象征 | galnt13 |
| 同义词 | Galnac-T13 |
| 描述 | 多肽N-乙酰乳糖酰氨基转移酶13 |
| 参考 | MIM：608369|HGNC：HGNC：23242|ENSEMBL：ENSG00000144278|HPRD：16325|Vega：Otthumg00000131917 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q24.1 |
| Pascal P值 | 0.017 |
| Sherlock P值 | 0.507 |
| 胎儿β | -0.96 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18311633 | 2 | 155309539 | galnt13 | 7.69e-5 | 0.553 | 0.025 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17572651 | CHR1 | 218943612 | galnt13 | 114805 | 0.16 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | galnt13 | 114805 | 0 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | galnt13 | 114805 | 0.01 | 反式 | ||
| RS6807632 | CHR3 | 111395567 | galnt13 | 114805 | 0.14 | 反式 | ||
| RS1368303 | CHR5 | 147672388 | galnt13 | 114805 | 0.06 | 反式 | ||
| RS11846721 | CHR14 | 63903555 | galnt13 | 114805 | 0.02 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | galnt13 | 114805 | 3.205E-7 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005529 | 糖结合 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0004653 | 多肽N-乙酰乳糖酰氨基转移酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016757 | 转移酶活性，转移糖基团 | IEA | - | |
| GO：0030145 | 锰离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006493 | 蛋白氨基酸O连接糖基化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg o glycan生物合成 | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组o粘蛋白的糖基化 | 59 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤UP | 35 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张GATA6靶向 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wagner Apo2敏感性 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-218 | 187 | 193 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-455 | 189 | 195 | 1a | HSA-MIR-455 | Uaugugccuuuggacuacaucg |