概括
基因 114815
象征 Sorcs1
同义词 hsorcs
描述 含有托硅蛋白相关的VPS10结构域含有受体1
参考 MIM:606283|HGNC:HGNC:16697|ENSEMBL:ENSG00000108018|HPRD:12098|Vega:Otthumg0000000019018
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q23-Q25
Pascal P值 0.029
Sherlock P值 0.915
胎儿β -0.51

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008188 神经肽受体活性 nas 神经递质(GO期限:8) 11499680
去:0005515 蛋白质结合 艾达 12482870
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12482870
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007218 神经肽信号通路 nas 神经递质(GO期限:8) 11499680
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 艾达 12482870
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-122 220 226 M8 HSA-MIR-122A uggagugugacaaugguuuugu
mir-124/506 2215 2221 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-193 10 16 1a HSA-MIR-193A Aacuggccuacaaagucccag
HSA-MIR-193B aacuggcccucaaagucccgcuuu
mir-219 57 63 1a HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-320 139 145 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-324-3p 188 194 M8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-330 3021 3027 M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-335 3263 3269 M8 HSA-MIR-335 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU
mir-339 2134 2140 1a HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-363 2801 2807 1a HSA-MIR-363 auugcacgguauccaucuguaa
mir-376c 3241 3247 1a HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-383 258 264 M8 HSA-MIR-383 agaucagaaggugauuguggcu
mir-384 2036 2042 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-452 2802 2809 1A,M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-486 194 200 M8 HSA-MIR-486 uccuguacugagcugcccccgag
mir-490 1394 1400 1a HSA-MIR-490 caaccuggaggacuaugcugcug
mir-500 2799 2806 1A,M8 HSA-MIR-500 augcaccuggggaggagauucug