基因页:OSBPL1A
概括?
基因 | 114876 |
象征 | OSBPL1A |
同义词 | ORP-1 | ORP1 | OSBPL1B |
描述 | 氧蛋白质结合蛋白(如1A) |
参考 | MIM:606730|HGNC:HGNC:16398|ENSEMBL:ENSG00000141447|HPRD:09472|Vega:Otthumg00000131944 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q11.1 |
Pascal P值 | 0.638 |
Sherlock P值 | 0.756 |
胎儿β | -2.334 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15211655 | 18 | 21977340 | OSBPL1A | 9.16e-11 | -0.012 | 4.49e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OSBPL1A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome MHC II类抗原表现 | 91 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤,带7Q缺失DN | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Baris甲状腺癌DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝克莫昔芬抵抗DN | 52 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL CBP融合DN的王目标 | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 | 120 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
croonquist nras发出信号 | 41 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌后期复发 | 62 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇7 | 118 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |