概括
基因 114904
象征 C1QTNF6
同义词 ctfp6 | ctrp6 | ZACRP6
描述 C1Q和肿瘤坏死因子相关蛋白6
参考 MIM:614910|HGNC:HGNC:14343|ENSEMBL:ENSG00000133466|HPRD:12718|Vega:Otthumg00000150538
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.1
Pascal P值 0.048
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS760521 CHR22 37247850 C1QTNF6 114904 0.06 顺式
RS1421313 22 37573429 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.383E-7 0 21996 gtex_brain_ba24
RS229510 22 37573794 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 6.895E-7 0 21631 gtex_brain_ba24
RS4821594 22 37573847 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.483e-8 0 21578 gtex_brain_ba24
RS9607421 22 37575931 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 8.281E-8 0 19494 gtex_brain_ba24
RS5756539 22 37577145 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 8.272E-8 0 18280 gtex_brain_ba24
RS229517 22 37577737 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.464e-8 0 17688 gtex_brain_ba24
RS916235 22 37578214 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.943E-8 0 17211 gtex_brain_ba24
RS229520 22 37578807 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 8.229e-8 0 16618 gtex_brain_ba24
RS4821596 22 37578995 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.751E-8 0 16430 gtex_brain_ba24
RS229524 22 37579803 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 9.588e-8 0 15622 gtex_brain_ba24
RS229525 22 37580334 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 8.517E-9 0 15091 gtex_brain_ba24
RS734139 22 37582166 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.802E-8 0 13259 gtex_brain_ba24
RS5756540 22 37582205 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.751E-8 0 13220 gtex_brain_ba24
RS4820270 22 37583096 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.8e-8 0 12329 gtex_brain_ba24
RS71324843 22 37583314 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.821E-8 0 12111 gtex_brain_ba24
RS11330876 22 37583578 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.802E-8 0 11847 gtex_brain_ba24
RS13057424 22 37584352 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.813E-8 0 11073 gtex_brain_ba24
RS229532 22 37586961 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.831E-8 0 8464 gtex_brain_ba24
RS229534 22 37588013 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.831E-8 0 7412 gtex_brain_ba24
RS58016280 22 37588076 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 6.423E-7 0 7349 gtex_brain_ba24
RS229535 22 37588566 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.828e-8 0 6859 gtex_brain_ba24
RS2858489 22 37590203 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.756E-8 0 5222 gtex_brain_ba24
RS2858490 22 37590207 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.817E-8 0 5218 gtex_brain_ba24
RS229537 22 37590302 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.817E-8 0 5123 gtex_brain_ba24
RS229538 22 37590718 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.042E-7 0 4707 gtex_brain_ba24
RS229539 22 37591261 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.065e-7 0 4164 gtex_brain_ba24
RS4140871 22 37594825 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.545e-7 0 600 gtex_brain_ba24
RS229517 22 37577737 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 9.639E-7 0 17688 gtex_brain_putamen_basal
RS916235 22 37578214 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.1E-6 0 17211 gtex_brain_putamen_basal
RS229520 22 37578807 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.821E-7 0 16618 gtex_brain_putamen_basal
RS229524 22 37579803 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.923E-6 0 15622 gtex_brain_putamen_basal
RS229525 22 37580334 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.309E-8 0 15091 gtex_brain_putamen_basal
RS229532 22 37586961 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.611E-8 0 8464 gtex_brain_putamen_basal
RS229534 22 37588013 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.611E-8 0 7412 gtex_brain_putamen_basal
RS58016280 22 37588076 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 5.389E-8 0 7349 gtex_brain_putamen_basal
RS229535 22 37588566 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.611E-8 0 6859 gtex_brain_putamen_basal
RS2858489 22 37590203 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.656E-8 0 5222 gtex_brain_putamen_basal
RS2858490 22 37590207 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.619E-8 0 5218 gtex_brain_putamen_basal
RS229537 22 37590302 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.619E-8 0 5123 gtex_brain_putamen_basal
RS229538 22 37590718 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 8.662e-8 0 4707 gtex_brain_putamen_basal
RS229539 22 37591261 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 8.711E-8 0 4164 gtex_brain_putamen_basal
RS229557 22 37596333 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 1.573E-8 0 -908 gtex_brain_putamen_basal
RS5995398 22 37598627 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.833e-7 0 -3202 gtex_brain_putamen_basal
RS229564 22 37599572 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 9.172E-7 0 -4147 gtex_brain_putamen_basal
RS739040 22 37599802 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.96E-7 0 -4377 gtex_brain_putamen_basal
RS229569 22 37603051 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.816E-8 0 -7626 gtex_brain_putamen_basal
RS86582 22 37603390 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.783E-8 0 -7965 gtex_brain_putamen_basal
RS86583 22 37603744 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.741E-8 0 -8319 gtex_brain_putamen_basal
RS69264 22 37603950 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.721E-8 0 -8525 gtex_brain_putamen_basal
RS9610669 22 37607981 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 4.574E-9 0 -12556 gtex_brain_putamen_basal
RS5756558 22 37608711 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.266E-9 0 -13286 gtex_brain_putamen_basal
RS4821603 22 37609294 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 3.276E-9 0 -13869 gtex_brain_putamen_basal
RS9622574 22 37610419 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 5.644e-8 0 -14994 gtex_brain_putamen_basal
RS9607425 22 37611392 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.884e-6 0 -15967 gtex_brain_putamen_basal
RS4821604 22 37611396 C1QTNF6 ENSG00000133466.9 2.916E-6 0 -15971 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色DN 74 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 128 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zembutsu对阿霉素的敏感性 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM有关联 171 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因