基因页:C1QTNF6
概括?
基因 | 114904 |
象征 | C1QTNF6 |
同义词 | ctfp6 | ctrp6 | ZACRP6 |
描述 | C1Q和肿瘤坏死因子相关蛋白6 |
参考 | MIM:614910|HGNC:HGNC:14343|ENSEMBL:ENSG00000133466|HPRD:12718|Vega:Otthumg00000150538 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.1 |
Pascal P值 | 0.048 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS760521 | CHR22 | 37247850 | C1QTNF6 | 114904 | 0.06 | 顺式 | ||
RS1421313 | 22 | 37573429 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.383E-7 | 0 | 21996 | gtex_brain_ba24 |
RS229510 | 22 | 37573794 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 6.895E-7 | 0 | 21631 | gtex_brain_ba24 |
RS4821594 | 22 | 37573847 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.483e-8 | 0 | 21578 | gtex_brain_ba24 |
RS9607421 | 22 | 37575931 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 8.281E-8 | 0 | 19494 | gtex_brain_ba24 |
RS5756539 | 22 | 37577145 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 8.272E-8 | 0 | 18280 | gtex_brain_ba24 |
RS229517 | 22 | 37577737 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.464e-8 | 0 | 17688 | gtex_brain_ba24 |
RS916235 | 22 | 37578214 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.943E-8 | 0 | 17211 | gtex_brain_ba24 |
RS229520 | 22 | 37578807 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 8.229e-8 | 0 | 16618 | gtex_brain_ba24 |
RS4821596 | 22 | 37578995 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.751E-8 | 0 | 16430 | gtex_brain_ba24 |
RS229524 | 22 | 37579803 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 9.588e-8 | 0 | 15622 | gtex_brain_ba24 |
RS229525 | 22 | 37580334 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 8.517E-9 | 0 | 15091 | gtex_brain_ba24 |
RS734139 | 22 | 37582166 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.802E-8 | 0 | 13259 | gtex_brain_ba24 |
RS5756540 | 22 | 37582205 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.751E-8 | 0 | 13220 | gtex_brain_ba24 |
RS4820270 | 22 | 37583096 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.8e-8 | 0 | 12329 | gtex_brain_ba24 |
RS71324843 | 22 | 37583314 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.821E-8 | 0 | 12111 | gtex_brain_ba24 |
RS11330876 | 22 | 37583578 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.802E-8 | 0 | 11847 | gtex_brain_ba24 |
RS13057424 | 22 | 37584352 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.813E-8 | 0 | 11073 | gtex_brain_ba24 |
RS229532 | 22 | 37586961 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.831E-8 | 0 | 8464 | gtex_brain_ba24 |
RS229534 | 22 | 37588013 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.831E-8 | 0 | 7412 | gtex_brain_ba24 |
RS58016280 | 22 | 37588076 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 6.423E-7 | 0 | 7349 | gtex_brain_ba24 |
RS229535 | 22 | 37588566 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.828e-8 | 0 | 6859 | gtex_brain_ba24 |
RS2858489 | 22 | 37590203 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.756E-8 | 0 | 5222 | gtex_brain_ba24 |
RS2858490 | 22 | 37590207 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.817E-8 | 0 | 5218 | gtex_brain_ba24 |
RS229537 | 22 | 37590302 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.817E-8 | 0 | 5123 | gtex_brain_ba24 |
RS229538 | 22 | 37590718 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.042E-7 | 0 | 4707 | gtex_brain_ba24 |
RS229539 | 22 | 37591261 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.065e-7 | 0 | 4164 | gtex_brain_ba24 |
RS4140871 | 22 | 37594825 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.545e-7 | 0 | 600 | gtex_brain_ba24 |
RS229517 | 22 | 37577737 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 9.639E-7 | 0 | 17688 | gtex_brain_putamen_basal |
RS916235 | 22 | 37578214 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.1E-6 | 0 | 17211 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229520 | 22 | 37578807 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.821E-7 | 0 | 16618 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229524 | 22 | 37579803 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.923E-6 | 0 | 15622 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229525 | 22 | 37580334 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.309E-8 | 0 | 15091 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229532 | 22 | 37586961 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.611E-8 | 0 | 8464 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229534 | 22 | 37588013 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.611E-8 | 0 | 7412 | gtex_brain_putamen_basal |
RS58016280 | 22 | 37588076 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 5.389E-8 | 0 | 7349 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229535 | 22 | 37588566 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.611E-8 | 0 | 6859 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2858489 | 22 | 37590203 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.656E-8 | 0 | 5222 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2858490 | 22 | 37590207 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.619E-8 | 0 | 5218 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229537 | 22 | 37590302 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.619E-8 | 0 | 5123 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229538 | 22 | 37590718 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 8.662e-8 | 0 | 4707 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229539 | 22 | 37591261 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 8.711E-8 | 0 | 4164 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229557 | 22 | 37596333 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 1.573E-8 | 0 | -908 | gtex_brain_putamen_basal |
RS5995398 | 22 | 37598627 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.833e-7 | 0 | -3202 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229564 | 22 | 37599572 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 9.172E-7 | 0 | -4147 | gtex_brain_putamen_basal |
RS739040 | 22 | 37599802 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.96E-7 | 0 | -4377 | gtex_brain_putamen_basal |
RS229569 | 22 | 37603051 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.816E-8 | 0 | -7626 | gtex_brain_putamen_basal |
RS86582 | 22 | 37603390 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.783E-8 | 0 | -7965 | gtex_brain_putamen_basal |
RS86583 | 22 | 37603744 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.741E-8 | 0 | -8319 | gtex_brain_putamen_basal |
RS69264 | 22 | 37603950 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.721E-8 | 0 | -8525 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9610669 | 22 | 37607981 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 4.574E-9 | 0 | -12556 | gtex_brain_putamen_basal |
RS5756558 | 22 | 37608711 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.266E-9 | 0 | -13286 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4821603 | 22 | 37609294 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 3.276E-9 | 0 | -13869 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9622574 | 22 | 37610419 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 5.644e-8 | 0 | -14994 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9607425 | 22 | 37611392 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.884e-6 | 0 | -15967 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4821604 | 22 | 37611396 | C1QTNF6 | ENSG00000133466.9 | 2.916E-6 | 0 | -15971 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C1QTNF6_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色DN | 74 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 | 128 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zembutsu对阿霉素的敏感性 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM有关联 | 171 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |