基因页:FBXO32
Summary?
GeneID | 114907 |
象征 | FBXO32 |
同义词 | FBX32 | MAFBX |
描述 | F-box蛋白32 |
参考 | MIM:606604|HGNC:HGNC:16731|ENSEMBL:ENSG00000156804|HPRD:05966|Vega:Otthumg00000164981 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q24.13 |
Pascal P值 | 0.488 |
Sherlock P值 | 0.911 |
DEG P值 | DEG:SANDERS_2014:DS1_P = -0.133:DS1_BETA = 0.038700:DS2_P = 5.47E-01:DS2_BETA = 0.028:DS2_FDR = 7.61E-01E-01 |
胎儿β | -1.02 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p值:1.411 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG20283107 | 8 | 124788969 | FBXO32 | 2.75E-6 | 7.448 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2922180 | CHR3 | 125280472 | FBXO32 | 114907 | 0.04 | 反式 | ||
RS16894149 | CHR5 | 61013724 | FBXO32 | 114907 | 0.02 | 反式 | ||
RS11954814 | CHR5 | 155088338 | FBXO32 | 114907 | 0.04 | 反式 | ||
RS283058 | CHR6 | 118625224 | FBXO32 | 114907 | 0.13 | 反式 | ||
rs3823550 | CHR7 | 137346101 | FBXO32 | 114907 | 0.09 | 反式 | ||
RS4149623 | CHR12 | 6450577 | FBXO32 | 114907 | 0.02 | 反式 | ||
RS9529974 | CHR13 | 72821935 | FBXO32 | 114907 | 0.16 | 反式 | ||
RS1951867 | CHR14 | 54407191 | FBXO32 | 114907 | 0.05 | 反式 | ||
RS17244419 | CHR14 | 97171074 | FBXO32 | 114907 | 0.17 | 反式 | ||
RS9627183 | CHR22 | 48284513 | FBXO32 | 114907 | 0.1 | 反式 | ||
RS9627184 | CHR22 | 48284887 | FBXO32 | 114907 | 0.15 | 反式 | ||
rs6988439 | 8 | 124522753 | FBXO32 | ENSG00000156804.3 | 1.446E-6 | 0 | 30693 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2294088 | 8 | 124526607 | FBXO32 | ENSG00000156804.3 | 6.719E-8 | 0 | 26839 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10111521 | 8 | 124528196 | FBXO32 | ENSG00000156804.3 | 4.287E-8 | 0 | 25250 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7834818 | 8 | 124529377 | FBXO32 | ENSG00000156804.3 | 8.336e-8 | 0 | 24069 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2385291 | 8 | 124536822 | FBXO32 | ENSG00000156804.3 | 3.483e-8 | 0 | 16624 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7818812 | 8 | 124538590 | FBXO32 | ENSG00000156804.3 | 1.312E-6 | 0 | 14856 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FBXO32_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-101 | 221 | 227 | 1a | hsa-miR-101 | uacaguacugauaacugaag |
mir-144 | 220 | 227 | 1A,M8 | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |