概括
基因 115123
象征 3月3日
同义词 3月III | RNF173
描述 膜相关的环形手指3
参考 MIM:613333|HGNC:HGNC:28728|ENSEMBL:ENSG00000173926|HPRD:14362|Vega:Otthumg00000128968
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q23.2
Pascal P值 2.303E-4
Sherlock P值 0.709
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17165234 CHR5 126403634 3月3日 115123 0.16 顺式
RS2670497 CHR15 99371240 3月3日 115123 0.09 反式
RS2684768 CHR15 99371420 3月3日 115123 0.1 反式
RS9319574 CHR16 82843166 3月3日 115123 0.14 反式
RS7268640 CHR20 47150267 3月3日 115123 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
去:0006897 内吞作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005768 内体 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -
去:0030659 细胞质囊泡膜 IEA -
GO:0031901 早期内体膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Davicioni pax foxo1手臂签名 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌类DN 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向E 97 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P7 90 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过KDM3A的Krieg缺氧 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 196 203 1A,M8 HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-143 509 515 M8 HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-148/152 54 60 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-182 225 231 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-377 761 768 1A,M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-544 552 558 M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu
mir-96 225 231 1a HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc