基因页:3月3日
概括?
基因 | 115123 |
象征 | 3月3日 |
同义词 | 3月III | RNF173 |
描述 | 膜相关的环形手指3 |
参考 | MIM:613333|HGNC:HGNC:28728|ENSEMBL:ENSG00000173926|HPRD:14362|Vega:Otthumg00000128968 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5q23.2 |
Pascal P值 | 2.303E-4 |
Sherlock P值 | 0.709 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17165234 | CHR5 | 126403634 | 3月3日 | 115123 | 0.16 | 顺式 | ||
RS2670497 | CHR15 | 99371240 | 3月3日 | 115123 | 0.09 | 反式 | ||
RS2684768 | CHR15 | 99371420 | 3月3日 | 115123 | 0.1 | 反式 | ||
RS9319574 | CHR16 | 82843166 | 3月3日 | 115123 | 0.14 | 反式 | ||
RS7268640 | CHR20 | 47150267 | 3月3日 | 115123 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MARCH3_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0006897 | 内吞作用 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005768 | 内体 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - | |
去:0030659 | 细胞质囊泡膜 | IEA | - | |
GO:0031901 | 早期内体膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Davicioni pax foxo1手臂签名 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多恩乳腺癌类DN | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向E | 97 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P7 | 90 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过KDM3A的Krieg缺氧 | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-103/107 | 196 | 203 | 1A,M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-143 | 509 | 515 | M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-148/152 | 54 | 60 | M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
mir-182 | 225 | 231 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-377 | 761 | 768 | 1A,M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-544 | 552 | 558 | M8 | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |
mir-96 | 225 | 231 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |