基因页:ddit4l
概括?
基因 | 115265 |
象征 | ddit4l |
同义词 | REDD2 | RTP801L |
描述 | DNA损伤诱导的成绩单4 |
参考 | MIM:607730|HGNC:HGNC:30555|ENSEMBL:ENSG00000145358|HPRD:09663|Vega:Otthumg00000161019 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q24 |
Pascal P值 | 0.129 |
Sherlock P值 | 0.268 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00360769 | 4 | 101110248 | ddit4l | 4.226E-4 | -0.375 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
CG02989600 | 4 | 101111617 | ddit4l | 2.75e-11 | -0.021 | 3.6e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12617409 | CHR2 | 1649924 | ddit4l | 115265 | 0.01 | 反式 | ||
RS1863135 | CHR2 | 1652821 | ddit4l | 115265 | 0.03 | 反式 | ||
RS7594023 | CHR2 | 1653884 | ddit4l | 115265 | 0.02 | 反式 | ||
RS1429237 | CHR2 | 5958773 | ddit4l | 115265 | 0.04 | 反式 | ||
RS17049408 | CHR2 | 58431128 | ddit4l | 115265 | 0.15 | 反式 | ||
RS260675 | CHR2 | 109600118 | ddit4l | 115265 | 0.01 | 反式 | ||
RS3747659 | CHR2 | 111744806 | ddit4l | 115265 | 0.02 | 反式 | ||
RS7574824 | CHR2 | 130696073 | ddit4l | 115265 | 0 | 反式 | ||
RS6719989 | CHR2 | 130737302 | ddit4l | 115265 | 0.19 | 反式 | ||
RS17013713 | CHR3 | 76105150 | ddit4l | 115265 | 0.18 | 反式 | ||
RS17007390 | CHR4 | 124705927 | ddit4l | 115265 | 0.05 | 反式 | ||
RS7734100 | CHR5 | 38376792 | ddit4l | 115265 | 0.12 | 反式 | ||
RS12055201 | CHR5 | 57401645 | ddit4l | 115265 | 0.18 | 反式 | ||
RS597544 | CHR6 | 49703856 | ddit4l | 115265 | 0.06 | 反式 | ||
RS10244048 | CHR7 | 100696615 | ddit4l | 115265 | 0.03 | 反式 | ||
RS16904520 | CHR8 | 132774255 | ddit4l | 115265 | 0.06 | 反式 | ||
RS16904581 | CHR8 | 133067536 | ddit4l | 115265 | 0.16 | 反式 | ||
RS2785092 | Chr9 | 26353892 | ddit4l | 115265 | 0.08 | 反式 | ||
RS400690 | Chr9 | 26395882 | ddit4l | 115265 | 0.08 | 反式 | ||
RS16910463 | Chr9 | 26444298 | ddit4l | 115265 | 0.05 | 反式 | ||
RS10989904 | Chr9 | 104990393 | ddit4l | 115265 | 0.11 | 反式 | ||
RS4750292 | Chr10 | 13016979 | ddit4l | 115265 | 5.697E-6 | 反式 | ||
RS7085725 | Chr10 | 106060208 | ddit4l | 115265 | 0.07 | 反式 | ||
RS276207 | Chr10 | 106065463 | ddit4l | 115265 | 0.07 | 反式 | ||
RS11191996 | Chr10 | 106065730 | ddit4l | 115265 | 0.07 | 反式 | ||
RS2282092 | Chr10 | 106068470 | ddit4l | 115265 | 0.07 | 反式 | ||
RS17091014 | CHR14 | 56562713 | ddit4l | 115265 | 3.372E-7 | 反式 | ||
RS9958820 | CHR18 | 4648247 | ddit4l | 115265 | 0.03 | 反式 | ||
RS1112963 | CHR18 | 4651534 | ddit4l | 115265 | 0 | 反式 | ||
RS7243836 | CHR18 | 65471624 | ddit4l | 115265 | 0.04 | 反式 | ||
RS5920627 | Chrx | 97385064 | ddit4l | 115265 | 0.01 | 反式 | ||
RS2205704 | Chrx | 132816690 | ddit4l | 115265 | 0.04 | 反式 | ||
RS2284128 | Chrx | 133096371 | ddit4l | 115265 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DDIT4L_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
chebotaev gr目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌F | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McGowan RSP6靶向 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Korkola胚胎癌与精液瘤DN | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TERAO AOX4靶向皮肤DN | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi直接辐照 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |