概括
基因 115265
象征 ddit4l
同义词 REDD2 | RTP801L
描述 DNA损伤诱导的成绩单4
参考 MIM:607730|HGNC:HGNC:30555|ENSEMBL:ENSG00000145358|HPRD:09663|Vega:Otthumg00000161019
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q24
Pascal P值 0.129
Sherlock P值 0.268
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00360769 4 101110248 ddit4l 4.226E-4 -0.375 0.045 DMG:Wockner_2014
CG02989600 4 101111617 ddit4l 2.75e-11 -0.021 3.6e-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12617409 CHR2 1649924 ddit4l 115265 0.01 反式
RS1863135 CHR2 1652821 ddit4l 115265 0.03 反式
RS7594023 CHR2 1653884 ddit4l 115265 0.02 反式
RS1429237 CHR2 5958773 ddit4l 115265 0.04 反式
RS17049408 CHR2 58431128 ddit4l 115265 0.15 反式
RS260675 CHR2 109600118 ddit4l 115265 0.01 反式
RS3747659 CHR2 111744806 ddit4l 115265 0.02 反式
RS7574824 CHR2 130696073 ddit4l 115265 0 反式
RS6719989 CHR2 130737302 ddit4l 115265 0.19 反式
RS17013713 CHR3 76105150 ddit4l 115265 0.18 反式
RS17007390 CHR4 124705927 ddit4l 115265 0.05 反式
RS7734100 CHR5 38376792 ddit4l 115265 0.12 反式
RS12055201 CHR5 57401645 ddit4l 115265 0.18 反式
RS597544 CHR6 49703856 ddit4l 115265 0.06 反式
RS10244048 CHR7 100696615 ddit4l 115265 0.03 反式
RS16904520 CHR8 132774255 ddit4l 115265 0.06 反式
RS16904581 CHR8 133067536 ddit4l 115265 0.16 反式
RS2785092 Chr9 26353892 ddit4l 115265 0.08 反式
RS400690 Chr9 26395882 ddit4l 115265 0.08 反式
RS16910463 Chr9 26444298 ddit4l 115265 0.05 反式
RS10989904 Chr9 104990393 ddit4l 115265 0.11 反式
RS4750292 Chr10 13016979 ddit4l 115265 5.697E-6 反式
RS7085725 Chr10 106060208 ddit4l 115265 0.07 反式
RS276207 Chr10 106065463 ddit4l 115265 0.07 反式
RS11191996 Chr10 106065730 ddit4l 115265 0.07 反式
RS2282092 Chr10 106068470 ddit4l 115265 0.07 反式
RS17091014 CHR14 56562713 ddit4l 115265 3.372E-7 反式
RS9958820 CHR18 4648247 ddit4l 115265 0.03 反式
RS1112963 CHR18 4651534 ddit4l 115265 0 反式
RS7243836 CHR18 65471624 ddit4l 115265 0.04 反式
RS5920627 Chrx 97385064 ddit4l 115265 0.01 反式
RS2205704 Chrx 132816690 ddit4l 115265 0.04 反式
RS2284128 Chrx 133096371 ddit4l 115265 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
chebotaev gr目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌F 54 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McGowan RSP6靶向 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Korkola胚胎癌与精液瘤DN 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4靶向皮肤DN 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi直接辐照 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因