基因页:UHRF2
概括?
基因 | 115426 |
象征 | UHRF2 |
同义词 | NIRF | RNF107 | TDRD23 | URF2 |
描述 | 泛素类似于博士和环形域2 |
参考 | MIM:615211|HGNC:HGNC:12557|ENSEMBL:ENSG00000147854|HPRD:18257|Vega:Otthumg0000000019521 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p24.1 |
Pascal P值 | 0.077 |
Sherlock P值 | 0.773 |
胎儿β | 1.236 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08487038 | 9 | 6413045 | UHRF2 | 1E-9 | -0.031 | 1.17E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UHRF2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
斯尼德斯在头部和颈部肿瘤中放大 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MA垂体胎儿与成人 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |