概括
基因 115677
象征 鼻孔
同义词 daip2
描述 一氧化氮合酶运输
参考 MIM:607496|HGNC:HGNC:20203|Ensembl:ENSG00000163072|HPRD:06324|Vega:Otthumg00000153990
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q31.1
Pascal P值 0.044
Sherlock P值 0.524
胎儿β -0.455
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02395

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18556822 2 169658881 鼻孔 1.42E-4 0.433 0.031 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9643114 CHR8 89933978 鼻孔 115677 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12446846
GO:0016564 转录阻遏活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0006897 内吞作用 IEA -
GO:0045892 转录,DNA依赖性的负调控 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005886 质膜 经验 16722822|16807357
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome Enos激活和调节 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因