基因页面:GRIN3A
总结吗?
| GeneID | 116443年 |
| 象征 | GRIN3A |
| 同义词 | GluN3A | NMDAR-L | NR3A |
| 描述 | 谷氨酸ionotropic NMDA受体亚基3类型 |
| 参考 | MIM: 606650|HGNC: HGNC: 16767|运用:ENSG00000198785|HPRD: 09443|织女:OTTHUMG00000020387 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 9 q31.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.178 |
| 夏洛克假定值 | 0.408 |
| 胎儿β | -1.9 |
| eGene | 元 |
| 支持 | 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:8 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004972 | n -甲基- d选择性谷氨酸受体的活动 | 艾达 | 谷氨酸(术语层面:8) | 17502428 |
| 去:0004972 | n -甲基- d选择性谷氨酸受体的活动 | 国际空间站 | 谷氨酸(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0005234 | extracellular-glutamate-gated离子通道的活动 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:11) | - - - - - - |
| 去:0000287 | 镁离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005262 | 钙通道活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005216 | 离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016594 | 甘氨酸绑定 | 艾达 | 17320117 | |
| 去:0042802 | 相同的蛋白结合 | 新闻学会 | 17997397 | |
| 去:0051721 | 蛋白磷酸酶2绑定 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016358 | 树突发展 | 国际能源机构 | 轴突、树突(术语层面:11) | - - - - - - |
| 去:0006816 | 钙离子传输 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045471 | 对乙醇 | 艾达 | 17502428|18445116 | |
| 去:0060134 | 前脉冲抑制 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0043025 | 细胞soma | 艾达 | 轴突、树突(术语级别:4) | 17658481 |
| 去:0043005 | 神经元投射 | 艾达 | 神经元,轴突、轴突、树突(术语层面:5) | 17658481 |
| 去:0017146 | n -甲基- d选择性谷氨酸受体复杂 | 艾达 | 谷氨酸,Synap(词级:10) | 17997397 |
| 去:0045211 | 突触后膜 | 国际能源机构 | Synap,神经递质(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0045202 | 突触 | 艾达 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | 17658481 |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | NAS | 11880201 | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 | 272年 | 195年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-10 | 190年 | 196年 | 1 | hsa-miR-10a | UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG |
| hsa-miR-10b | UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU | ||||
| miR-124/506 | 817年 | 823年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| miR-141/200a | 2716年 | 2722年 | m8 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
| mir - 186 | 2324年 | 2330年 | m8 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
| miR-33 | 2354年 | 2360年 | 1 | hsa-miR-33 | GUGCAUUGUAGUUGCAUUG |
| hsa-miR-33b | GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA | ||||
| mir - 370 | 2568年 | 2574年 | m8 | hsa - mir - 370大脑 | GCCUGCUGGGGUGGAACCUGG |
| mir - 421 | 2434年 | 2440年 | 1 | hsa - mir - 421 | GGCCUCAUUAAAUGUUUGUUG |