基因页:apoa5
概括?
基因 | 116519 |
象征 | apoa5 |
同义词 | Apoav | Rap3 |
描述 | 载脂蛋白A-V |
参考 | MIM:606368|HGNC:HGNC:17288|ENSEMBL:ENSG00000110243|HPRD:06966|Vega:Otthumg00000046116 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11Q23 |
Pascal P值 | 0.466 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/APOA5_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005319 | 脂质转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0008201 | 肝素约束 | 艾达 | 15878877 | |
去:0008201 | 肝素约束 | 艾达 | 17326667 | |
GO:0017129 | 甘油三酸酯结合 | IEA | - | |
GO:0031210 | 磷脂酰胆碱结合 | 艾达 | 16806135 | |
GO:0019899 | 酶结合 | 艾达 | 15178420 | |
GO:0050750 | 低密度脂蛋白受体结合 | IPI | 17326667 | |
GO:0060229 | 脂肪酶激活剂活性 | 小鬼 | 15178420 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006869 | 脂质运输 | IEA | - | |
GO:0042246 | 组织再生 | IEP | 11577099 | |
去:0051006 | 脂蛋白脂肪酶活性的阳性调节 | 艾达 | 15178420|16806135 | |
GO:0042159 | 脂蛋白分解代谢过程 | IEA | - | |
GO:0019433 | 三酰基甘油分解代谢过程 | 小鬼 | 15178420 | |
去:0050996 | 脂质分解代谢过程的阳性调节 | 艾达 | 16806135 | |
GO:0055090 | 酰基甘油稳态 | 艾达 | 11588264 | |
GO:0055090 | 酰基甘油稳态 | 小鬼 | 15178420 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 艾达 | 11577099 | |
GO:0034364 | 高密度脂蛋白颗粒 | 艾达 | 15528295 | |
GO:0034362 | 低密度脂蛋白颗粒 | 艾达 | 15528295 | |
GO:0034361 | 非常低密度的脂蛋白颗粒 | 艾达 | 15528295 | |
GO:0042627 | 乳糜微粒 | 艾达 | 15528295 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg ppar信号通路 | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Ppara激活基因表达 | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome脂质消化和运输 | 46 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂蛋白代谢 | 28 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Chylomicron介导的脂质转运 | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UEDA PERIFERAL CHICK | 169 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌干细胞DN | 76 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-24 | 53 | 59 | M8 | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |