基因页面:HSPA12B
总结吗?
GeneID | 116835年 |
象征 | HSPA12B |
同义词 | C20orf60 |
描述 | 热休克蛋白家族(Hsp70)成员12 b |
参考 | MIM: 610702|HGNC: HGNC: 16193|运用:ENSG00000132622|HPRD: 13683|织女:OTTHUMG00000031755 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 20 p13 |
帕斯卡假定值 | 0.438 |
胎儿β | -0.353 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 尾状基底神经节 小脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg04094751 | 20. | 3725861 | HSPA12B | 4.151的军医 | -0.789 | 0.044 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs45495794 | 20. | 3734167 | HSPA12B | ENSG00000132622.6 | 6.49905 e-11 | 0 | 20853年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HSPA12B_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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江缺氧癌症 | 83年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由喀斯特DN IWANAGA致癌 | 120年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森ES ICP H3K4ME3和H3K27ME3 | 137年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |