基因页：AGAP1
概括？
| 基因 | 116987 |
| 象征 | AGAP1 |
| 同义词 | AGAP-1 | centg2 | ggap1 | cnt-g2 |
| 描述 | 用GTPase结构域，Ankyrin重复和pH结构域1的ARFGAP 1 |
| 参考 | MIM：608651|HGNC：HGNC：16922|Ensembl：ENSG00000157985|HPRD：16359|Vega：Otthumg00000133293 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2Q37 |
| Pascal P值 | 0.003 |
| Sherlock P值 | 0.214 |
| 胎儿β | -0.062 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 5 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 5 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13451416 | 2 | 236671149 | AGAP1 | 1.15e-5 | -0.005 | 0.046 | DMG：Montano_2016 |
| CG24768561 | 2 | 236401800 | AGAP1 | 1.554E-4 | 0.312 | 0.032 | DMG：Wockner_2014 |
| CG20302069 | 2 | 237015746 | AGAP1 | 2.322E-4 | -0.403 | 0.037 | DMG：Wockner_2014 |
| CG13524563 | 2 | 236471576 | AGAP1 | 3.251E-4 | 0.375 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
| CG16452565 | 2 | 236507151 | AGAP1 | 3.321E-4 | 0.46 | 0.041 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS830202 | CHR3 | 165654796 | AGAP1 | 116987 | 0.04 | 反式 | ||
| RS2412058 | Chr11 | 2641128 | AGAP1 | 116987 | 0.13 | 反式 | ||
| RS1324669 | CHR13 | 107872446 | AGAP1 | 116987 | 0.08 | 反式 | ||
| RS6015314 | CHR20 | 57167224 | AGAP1 | 116987 | 0.02 | 反式 | ||
| RS17145698 | Chrx | 40218345 | AGAP1 | 116987 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合目标F DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Theodorou乳腺肿瘤发生 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤MS | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sarrio上皮间质转变 | 180 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |