基因页:adcyap1r1
概括?
基因 | 117 |
象征 | adcyap1r1 |
同义词 | pac1 | pac1r | pacapr | pacapri |
描述 | adcyap受体I型 |
参考 | MIM:102981|HGNC:HGNC:242|Ensembl:ENSG0000000078549|HPRD:00045|Vega:Otthumg0000000023884 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p14 |
Pascal P值 | 0.03 |
胎儿β | 0.074 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01091029 | 7 | 31232532 | adcyap1r1 | 3.83e-8 | -0.021 | 1.09E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
CG02418899 | 7 | 31092589 | adcyap1r1 | 7E-8 | -0.016 | 1.69E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ADCYAP1R1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
kat2b | 0.92 | 0.91 |
PLSCR4 | 0.90 | 0.91 |
cybrd1 | 0.88 | 0.89 |
gramd3 | 0.88 | 0.83 |
DTNA | 0.88 | 0.88 |
SLC4A4 | 0.87 | 0.89 |
ranbp3l | 0.87 | 0.84 |
Ahcyl1 | 0.87 | 0.88 |
AQP4 | 0.87 | 0.84 |
glud1 | 0.86 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC011491.1 | -0.49 | -0.54 |
mpp3 | -0.47 | -0.39 |
Med19 | -0.47 | -0.51 |
ZNF821 | -0.47 | -0.41 |
NR2C2AP | -0.47 | -0.49 |
KIAA1949 | -0.46 | -0.30 |
DPF1 | -0.46 | -0.40 |
RP9 | -0.46 | -0.52 |
Gmip | -0.46 | -0.36 |
SH2B2 | -0.46 | -0.48 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome B类2 Secralin家族受体 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胰高血糖素型配体受体 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha的信号事件 | 121 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Delta FOSB目标8WK | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vernochet脂肪形成 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |