基因页:rab3ip
概括?
基因 | 117177 |
象征 | rab3ip |
同义词 | Rabin3 | Rabin8 |
描述 | Rab3a相互作用的蛋白质 |
参考 | MIM:608686|HGNC:HGNC:16508|ENSEMBL:ENSG00000127328|HPRD:10565|Vega:Otthumg00000169437 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2015年第12季度 |
Pascal P值 | 9.862e-4 |
Sherlock P值 | 0.87 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11177823 | CHR12 | 70139672 | rab3ip | 117177 | 0.2 | 顺式 | ||
RS1152952 | CHR12 | 70347023 | rab3ip | 117177 | 0.08 | 顺式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | rab3ip | 117177 | 9.81E-5 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | rab3ip | 117177 | 0 | 反式 | ||
RS7033804 | Chr9 | 25570478 | rab3ip | 117177 | 0.11 | 反式 | ||
RS504578 | Chr11 | 78862291 | rab3ip | 117177 | 0.09 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | rab3ip | 117177 | 1.3e-12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RAB3IP_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi对romidepsin的反应 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌12q13 Q21 Amplicon | 46 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1 DN | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |