SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	1173
Symbol	AP2M1
同义词	AP50\|CLAPM1\|mu2
描述	adaptor related protein complex 2 mu 1 subunit
参考	MIM:601024\|HGNC:HGNC:564\|Ensembl:ENSG00000161203\|HPRD:03014\|Vega：Otthumg00000156822
基因type	protein-coding
地图位置	3q28
Pascal P值	0.301
Sherlock P值	0.826
Fetal beta	-0.87
DMG	2 (# studies)
支持	ENDOCYTOSIS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS COMPOSITESET

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG:Jaffe_2016	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05.	2
DMG:Montano_2016	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 172 replicated associations between CpGs with schizophrenia.	2

第一节遗传学和表观遗传学注释

Differentially methylated gene

探测	Chromosome	Position	Nearest gene	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
cg17343451	3	183899704	AP2M1	3.2E-4	0.006	0.184	DMG:Montano_2016
CG23679085	3	183892773	AP2M1	7.35E-9	-0.008	3.66E-6	DMG:Jaffe_2016

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
TM9SF3	0.95	0.95
FBXW11	0.92	0.91
ZDHHC17	0.92	0.92
LONP2	0.91	0.90
PDZD8	0.91	0.91
HIPK3	0.91	0.92
GARNL1	0.90	0.91
APPL1	0.90	0.92
FAM91A1	0.90	0.92
SERINC1	0.90	0.89

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
AF347015.21	-0.65	-0.55
FXYD1	-0.62	-0.55
C1orf54	-0.61	-0.58
MT-CO2	-0.61	-0.56
higd1b	-0.60	-0.55
增强	-0.60	-0.60
IL32	-0.60	-0.52
VAMP5	-0.59	-0.49
CSAG1	-0.59	-0.53
C1orf61	-0.58	-0.63

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
ADRA1B	ADRA1 \| ALPHA1BAR	adrenergic, alpha-1B-, receptor	Affinity Capture-Western 两个杂交	BioGRID	12644451
AP2B1	ADTB2 \| AP105B \| AP2-BETA \| CLAPB1 \| DKFZp781K0743	adaptor-related protein complex 2, beta 1 subunit	两个杂交	BioGRID	16189514
AQP4	HMIWC2 \| MGC22454 \| MIWC	aquaporin 4	-	HPRD，Biogrid	11742978
CD22	FLJ22814 \|MGC130020 \|SIGLEC-2 \|SIGLEC2	CD22 molecule	-	HPRD，Biogrid	12646615
CLEC4M	CD209L \| CD299 \| DC-SIGN2 \| DC-SIGNR \| DCSIGNR \| HP10347 \| L-SIGN \| LSIGN \| MGC129964 \| MGC47866	C型凝集素域家族4，成员M	Affinity Capture-Western	BioGRID	12621057
CTLA4	CD152 \| CELIAC3 \| CTLA-4 \| GSE \| IDDM12	细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4	Affinity Capture-Western Co-crystal Structure Reconstituted Complex 两个杂交	BioGRID	9200449\|11583591
CTLA4	CD152 \| CELIAC3 \| CTLA-4 \| GSE \| IDDM12	细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4	-	HPRD	9200449\|9256472 \|11583591 \| 9256472
DAB2	DOC-2 \| DOC2 \| FLJ26626	disabled homolog 2, mitogen-responsive phosphoprotein (Drosophila)	-	HPRD	11247302
DCX	DBCN \| DC \| LISX \| SCLH \| XLIS	doublecortin	-	HPRD	11591131
DPPA2	PESCRG1	developmental pluripotency associated 2	两个杂交	BioGRID	16189514
DVL2	-	dishevelled, dsh homolog 2 (Drosophila)	两个杂交	BioGRID	16189514
EHD2	FLJ96617 \|过去2	含有2的EH域	-	HPRD，Biogrid	15182197
FURIN	FUR \| PACE \| PCSK3 \| SPC1	furin (paired basic amino acid cleaving enzyme)	-	HPRD，Biogrid	10593987
FXR2	FMR1L2	脆弱的X心理迟缓，常染色体同源物2	两个杂交	BioGRID	16189514
IKZF1	Hs.54452 \| IK1 \| IKAROS \| LYF1 \| PRO0758 \| ZNFN1A1 \| hIk-1	IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)	两个杂交	BioGRID	16189514
L1CAM	CAML1 \|CD171 \|HSAS \|HSAS1 \|Masa \|麦克风5 \|n-caml1 \|S10 \|SPG1	L1 cell adhesion molecule	L1CAM interacts with AP-2 mu2 chain. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human L1CAM and AP-2 mu2 chain from an unspecified species.	BIND	15647482
LAMP1	CD107a \| LAMPA \| LGP120	溶酶体相关膜蛋白1	-	HPRD，Biogrid	7569928
LY9	CD229 \|slamf3 \|Hly9 \|mly9	lymphocyte antigen 9	-	HPRD，Biogrid	12621057
MED4	DRIP36 \| FLJ10956 \| HSPC126 \| RP11-90M2.2 \| TRAP36 \| VDRIP	mediator complex subunit 4	两个杂交	BioGRID	16189514
MEGF10	DKFZp781K1852 \| FLJ41574 \| KIAA1780	multiple EGF-like-domains 10	-	HPRD	12421765
ralbp1	RIP1 \|rlip1 \|rlip76	ralA binding protein 1	RLIP76与MU-2相互作用。	BIND	10910768
RTDR1	MGC16968	色肽肿瘤缺失区域基因1	两个杂交	BioGRID	16189514
rundc3a	RAP2IP \| RPIP8	运行包含3A的域	两个杂交	BioGRID	16189514
STON2	stn2 \|STNB \|STNB2	stonin 2	Reconstituted Complex	BioGRID	11454741
TBC1D5	KIAA0210	TBC1域家庭，成员5	两个杂交	BioGRID	16189514
TGOLN2	MGC14722 \| TGN38 \| TGN46 \| TGN48 \| TGN51 \| TTGN2	反式高尔基网络蛋白2	TGN38 interacts with Mu2. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between TGN38 from unspecified species and rat Mu2.	BIND	15916959
ZBTB8	BOZF1 \| FLJ90065 \| MGC17919	锌指和包含8个的BTB结构域	两个杂交	BioGRID	16189514

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG ENDOCYTOSIS	183	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Huntingtons病	185	109	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA NDKDYNAMIN PATHWAY	21	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PTDINS PATHWAY	23	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BARRESTIN PATHWAY	10	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF 3PATHWAY	19	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GAP JUNCTION DEGRADATION	10	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导	217	167	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学	396	292	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MEMBRANE TRAFFICKING	129	74	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEF MEDIATES DOWN MODULATION OF CELL SURFACE RECEPTORS BY RECRUITING THEM TO CLATHRIN ADAPTERS	21	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY EGFR IN CANCER	109	80	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NGF SIGNALLING VIA TRKA FROM THE PLASMA MEMBRANE	137	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MHC II类抗原表现	91	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RETROGRADE NEUROTROPHIN SIGNALLING	13	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME EGFR DOWNREGULATION	25	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMISSION ACROSS CHEMICAL SYNAPSES	186	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统	279	221	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEUROTRANSMITTER RECEPTOR BINDING AND DOWNSTREAM TRANSMISSION IN THE POSTSYNAPTIC CELL	137	110	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE	251	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMPA受体的Reactome贩运	28	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRAFFICKING OF GLUR2 CONTAINING AMPA RECEPTORS	16	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME L1CAM INTERACTIONS	86	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1反应组信号转导	34	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1的Reactome回收途径	27	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HIV INFECTION	207	122	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用	132	81	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME THE ROLE OF NEF IN HIV1 REPLICATION AND DISEASE PATHOGENESIS	28	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统	933	616	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM	539	350	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GAP JUNCTION TRAFFICKING	27	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN	526	357	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN	663	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP	1382	904	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状	112	71	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向	112	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射5的响应5	147	89	该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大	214	139	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STARK PREFRONTAL CORTEX 22Q11 DELETION DN	517	309	该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN	408	274	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN	1237	837	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING HYPOTHALAMUS DN	40	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
兰普早期丰富学习环境	15	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX DN	54	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络	1210	725	该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍少突细胞数量。柯尔	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN	211	119	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：AP2M1