基因页:AP1S1
概括?
基因 | 1174 |
象征 | AP1S1 |
同义词 | ap19 | claps1 | ekv3 | mednik | sigma1a |
描述 | 适配器相关的蛋白质复合物1 Sigma 1亚基 |
参考 | MIM:603531|HGNC:HGNC:559|ENSEMBL:ENSG00000106367|HPRD:04635|Vega:Otthumg00000157103 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q22.1 |
Pascal P值 | 0.049 |
Sherlock P值 | 0.545 |
主持人 | 小脑半球 小脑 下丘脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17795337 | CHR6 | 136492658 | AP1S1 | 1174 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AP1S1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
hecw1 | 0.91 | 0.91 |
A2BP1 | 0.90 | 0.92 |
megf9 | 0.90 | 0.92 |
是的 | 0.90 | 0.93 |
tspyl5 | 0.90 | 0.93 |
EAF1 | 0.90 | 0.92 |
fto | 0.89 | 0.91 |
exoc6b | 0.88 | 0.92 |
Atrn | 0.88 | 0.92 |
SEL1L | 0.88 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.64 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.64 | -0.68 |
higd1b | -0.63 | -0.68 |
Rab34 | -0.63 | -0.70 |
MT-CO2 | -0.63 | -0.68 |
S100A16 | -0.63 | -0.66 |
AF347015.21 | -0.63 | -0.70 |
AP002478.3 | -0.63 | -0.69 |
ACSF2 | -0.62 | -0.66 |
TLCD1 | -0.62 | -0.65 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NEF介导的MHC I类复杂细胞表面表达的下调 | 10 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Nef通过募集到网格蛋白适配器来介导细胞表面受体的调节 | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome MHC II类抗原表现 | 91 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组溶酶体囊泡生物发生 | 23 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NEF在HIV1复制和疾病发病机理中的作用 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王攀登目标DN | 186 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer Pthlh靶向 | 112 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标8小时DN | 129 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell转移DN | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应120 MCF10A | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5目标9小时DN | 41 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |