概括
基因 1178
象征 Clc
同义词 gal10 | gal-10 | lgals10 | lgals10a | lppl_human
描述 charcot-leyden水晶乳糖素
参考 MIM:153310|HGNC:HGNC:2014|Ensembl:ENSG00000105205|HPRD:08351|Vega:Otthumg00000183144
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.1
Pascal P值 0.294
胎儿β 0.963

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
trim7 0.41 0.29
fut7 0.40 0.31
SLC22A20 0.39 0.28
AL133215.4 0.38 0.30
最好的4 0.38 0.37
C15orf62 0.37 0.30
MAPK12 0.37 0.26
insrr 0.37 0.27
TFAP2E 0.37 0.33
C3orf62 0.36 0.29
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SCG3 -0.23 -0.24
lyrm5 -0.20 -0.23
ifih1 -0.20 -0.22
CBR3 -0.19 -0.21
FAM162A -0.19 -0.18
RLBP1 -0.18 -0.20
FAM162B -0.18 -0.17
PRDX1 -0.18 -0.16
ELTD1 -0.18 -0.19
9月7日 -0.17 -0.16

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞DN的TONKS目标 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合的tonks靶标在单核细胞DN中维持 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与CML划分DN 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML分裂与正常分裂 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML分割与正常静止 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牛甲基化的乳腺癌 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中岛嗜酸性粒细胞 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hofmann骨髓发育异常综合症高风险DN 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRA与基质刺激DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez Waldenstroems大球蛋白血症2 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
绅士白血病干细胞DN 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM有关联 171 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因