基因页:Clc
概括?
基因 | 1178 |
象征 | Clc |
同义词 | gal10 | gal-10 | lgals10 | lgals10a | lppl_human |
描述 | charcot-leyden水晶乳糖素 |
参考 | MIM:153310|HGNC:HGNC:2014|Ensembl:ENSG00000105205|HPRD:08351|Vega:Otthumg00000183144 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.1 |
Pascal P值 | 0.294 |
胎儿β | 0.963 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CLC_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
trim7 | 0.41 | 0.29 |
fut7 | 0.40 | 0.31 |
SLC22A20 | 0.39 | 0.28 |
AL133215.4 | 0.38 | 0.30 |
最好的4 | 0.38 | 0.37 |
C15orf62 | 0.37 | 0.30 |
MAPK12 | 0.37 | 0.26 |
insrr | 0.37 | 0.27 |
TFAP2E | 0.37 | 0.33 |
C3orf62 | 0.36 | 0.29 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SCG3 | -0.23 | -0.24 |
lyrm5 | -0.20 | -0.23 |
ifih1 | -0.20 | -0.22 |
CBR3 | -0.19 | -0.21 |
FAM162A | -0.19 | -0.18 |
RLBP1 | -0.18 | -0.20 |
FAM162B | -0.18 | -0.17 |
PRDX1 | -0.18 | -0.16 |
ELTD1 | -0.18 | -0.19 |
9月7日 | -0.17 | -0.16 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合单核细胞DN的TONKS目标 | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合的tonks靶标在单核细胞DN中维持 | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML静止与CML划分DN | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML分裂与正常分裂 | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牛甲基化的乳腺癌 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中岛嗜酸性粒细胞 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hofmann骨髓发育异常综合症高风险DN | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist NRA与基质刺激DN | 99 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez Waldenstroems大球蛋白血症2 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
绅士白血病干细胞DN | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM有关联 | 171 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |