基因页:clcn1
概括?
基因 | 1180 |
象征 | clcn1 |
同义词 | Clc1 |
描述 | 氯化电压门控通道1 |
参考 | MIM:118425|HGNC:HGNC:2019|ENSEMBL:ENSG00000188037|HPRD:00320|Vega:Otthumg00000152695 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q35 |
Pascal P值 | 0.026 |
TADA P值 | 0.002 |
胎儿β | -0.399 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
clcn1 | CHR7 | 143013326..143013327 | GC | G | NM_000083 NR_046453 |
。 。 |
边框 npcrna |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CLCN1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Borczuk恶性间皮瘤DN | 104 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ellwood MYC的目标 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Maekawa ATF2目标 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |