概括
基因 119391
象征 GSTO2
同义词 GSTO 2-2 | BA127L20.1
描述 谷胱甘肽S-转移酶欧米茄2
参考 MIM:612314|HGNC:HGNC:23064|Ensembl:ENSG0000000065621|HPRD:13614|Vega:Otthumg0000000019006
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q25.1
Pascal P值 5.39E-4
Sherlock P值 0.003
胎儿β -1.511
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11191940 Chr10 105941043 GSTO2 119391 0.1 顺式
RS11191953 Chr10 105982726 GSTO2 119391 0.16 顺式
RS4925 Chr10 106022788 GSTO2 119391 0 顺式
RS156697 Chr10 106039184 GSTO2 119391 2.934E-6 顺式
RS276203 Chr10 106039302 GSTO2 119391 2.896E-6 顺式
RS156699 Chr10 106053640 GSTO2 119391 1.101E-5 顺式
RS157081 Chr10 106055023 GSTO2 119391 1.731E-5 顺式
RS10491046 Chr10 106071000 GSTO2 119391 5.7e-4 顺式
RS10883991 Chr10 106077585 GSTO2 119391 0.02 顺式
RS276219 Chr10 106087511 GSTO2 119391 0.08 顺式
RS276215 Chr10 106089381 GSTO2 119391 0.04 顺式
RS276213 Chr10 106091094 GSTO2 119391 0.17 顺式
RS7083064 Chr10 106138538 GSTO2 119391 0.18 顺式
RS4925 Chr10 106022788 GSTO2 119391 0.1 反式
RS156697 Chr10 106039184 GSTO2 119391 5.015E-4 反式
RS276203 Chr10 106039302 GSTO2 119391 4.928E-4 反式
RS156699 Chr10 106053640 GSTO2 119391 0 反式
RS157081 Chr10 106055023 GSTO2 119391 0 反式
RS10491046 Chr10 106071000 GSTO2 119391 0.04 反式
RS612406 10 106005735 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.623E-6 0 -22896 gtex_brain_ba24
RS17883150 10 106013050 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.593E-7 0 -15581 gtex_brain_ba24
RS2164624 10 106013445 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.474E-7 0 -15186 gtex_brain_ba24
RS397752173 10 106014764 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.838E-6 0 -13867 gtex_brain_ba24
RS10883990 10 106018558 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.285E-7 0 -10073 gtex_brain_ba24
RS2282326 10 106020398 GSTO2 ENSG0000000065621.10 4.389E-8 0 -8233 gtex_brain_ba24
RS4925 10 106022789 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.258E-7 0 -5842 gtex_brain_ba24
RS11191979 10 106024867 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.258E-7 0 -3764 gtex_brain_ba24
RS1147611 10 106025258 GSTO2 ENSG0000000065621.10 4.331E-8 0 -3373 gtex_brain_ba24
RS45596840 10 106028154 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.238E-7 0 -477 gtex_brain_ba24
RS641071 10 106028157 GSTO2 ENSG0000000065621.10 4.267E-8 0 -474 gtex_brain_ba24
RS11191980 10 106032213 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.862e-8 0 3582 gtex_brain_ba24
RS568526 10 106033439 GSTO2 ENSG0000000065621.10 8.599E-9 0 4808 gtex_brain_ba24
RS17826034 10 106033504 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.862e-8 0 4873 gtex_brain_ba24
RS2297235 10 106034491 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.862e-8 0 5860 gtex_brain_ba24
RS276204 10 106035313 GSTO2 ENSG0000000065621.10 8.599E-9 0 6682 gtex_brain_ba24
RS157077 10 106037894 GSTO2 ENSG0000000065621.10 7.852e-7 0 9263 gtex_brain_ba24
RS7099030 10 106038347 GSTO2 ENSG0000000065621.10 3.782E-8 0 9716 gtex_brain_ba24
RS156697 10 106039185 GSTO2 ENSG0000000065621.10 8.599E-9 0 10554 gtex_brain_ba24
RS276203 10 106039303 GSTO2 ENSG0000000065621.10 8.599E-9 0 10672 gtex_brain_ba24
RS6584592 10 106039780 GSTO2 ENSG0000000065621.10 3.839E-8 0 11149 gtex_brain_ba24
RS1865926 10 106042502 GSTO2 ENSG0000000065621.10 4.301E-8 0 13871 gtex_brain_ba24
RS7079338 10 106043132 GSTO2 ENSG0000000065621.10 7.904e-8 0 14501 gtex_brain_ba24
RS397712198 10 106045962 GSTO2 ENSG0000000065621.10 3.507E-8 0 17331 gtex_brain_ba24
RS276210 10 106046403 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.077E-8 0 17772 gtex_brain_ba24
RS987247 10 106046768 GSTO2 ENSG0000000065621.10 6.741E-8 0 18137 gtex_brain_ba24
RS157076 10 106048294 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.043e-8 0 19663 gtex_brain_ba24
RS11191989 10 106050315 GSTO2 ENSG0000000065621.10 6.714E-8 0 21684 gtex_brain_ba24
RS156699 10 106053641 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.069e-8 0 25010 gtex_brain_ba24
RS157081 10 106055024 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.069e-8 0 26393 gtex_brain_ba24
RS157080 10 106055963 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.069e-8 0 27332 gtex_brain_ba24
RS3740466 10 106061169 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.196E-7 0 32538 gtex_brain_ba24
RS397760147 10 106065999 GSTO2 ENSG0000000065621.10 7.905E-8 0 37368 gtex_brain_ba24
RS11191999 10 106066436 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.656E-6 0 37805 gtex_brain_ba24
RS11192001 10 106067978 GSTO2 ENSG0000000065621.10 6.714E-8 0 39347 gtex_brain_ba24
RS201853039 10 106069081 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.75E-6 0 40450 gtex_brain_ba24
RS199914302 10 106069085 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.279E-7 0 40454 gtex_brain_ba24
RS10491046 10 106071001 GSTO2 ENSG0000000065621.10 6.714E-8 0 42370 gtex_brain_ba24
RS276209 10 106072527 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.069e-8 0 43896 gtex_brain_ba24
RS505701 10 106073566 GSTO2 ENSG0000000065621.10 2.069e-8 0 44935 gtex_brain_ba24
RS11595547 10 106076414 GSTO2 ENSG0000000065621.10 1.538E-7 0 47783 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg谷胱甘肽代谢 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG药物代谢细胞色素P450 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维生素和辅因子的反应组代谢 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome谷胱甘肽结合 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome II期结合 70 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因