基因页:GSTO2
概括?
基因 | 119391 |
象征 | GSTO2 |
同义词 | GSTO 2-2 | BA127L20.1 |
描述 | 谷胱甘肽S-转移酶欧米茄2 |
参考 | MIM:612314|HGNC:HGNC:23064|Ensembl:ENSG0000000065621|HPRD:13614|Vega:Otthumg0000000019006 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q25.1 |
Pascal P值 | 5.39E-4 |
Sherlock P值 | 0.003 |
胎儿β | -1.511 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11191940 | Chr10 | 105941043 | GSTO2 | 119391 | 0.1 | 顺式 | ||
RS11191953 | Chr10 | 105982726 | GSTO2 | 119391 | 0.16 | 顺式 | ||
RS4925 | Chr10 | 106022788 | GSTO2 | 119391 | 0 | 顺式 | ||
RS156697 | Chr10 | 106039184 | GSTO2 | 119391 | 2.934E-6 | 顺式 | ||
RS276203 | Chr10 | 106039302 | GSTO2 | 119391 | 2.896E-6 | 顺式 | ||
RS156699 | Chr10 | 106053640 | GSTO2 | 119391 | 1.101E-5 | 顺式 | ||
RS157081 | Chr10 | 106055023 | GSTO2 | 119391 | 1.731E-5 | 顺式 | ||
RS10491046 | Chr10 | 106071000 | GSTO2 | 119391 | 5.7e-4 | 顺式 | ||
RS10883991 | Chr10 | 106077585 | GSTO2 | 119391 | 0.02 | 顺式 | ||
RS276219 | Chr10 | 106087511 | GSTO2 | 119391 | 0.08 | 顺式 | ||
RS276215 | Chr10 | 106089381 | GSTO2 | 119391 | 0.04 | 顺式 | ||
RS276213 | Chr10 | 106091094 | GSTO2 | 119391 | 0.17 | 顺式 | ||
RS7083064 | Chr10 | 106138538 | GSTO2 | 119391 | 0.18 | 顺式 | ||
RS4925 | Chr10 | 106022788 | GSTO2 | 119391 | 0.1 | 反式 | ||
RS156697 | Chr10 | 106039184 | GSTO2 | 119391 | 5.015E-4 | 反式 | ||
RS276203 | Chr10 | 106039302 | GSTO2 | 119391 | 4.928E-4 | 反式 | ||
RS156699 | Chr10 | 106053640 | GSTO2 | 119391 | 0 | 反式 | ||
RS157081 | Chr10 | 106055023 | GSTO2 | 119391 | 0 | 反式 | ||
RS10491046 | Chr10 | 106071000 | GSTO2 | 119391 | 0.04 | 反式 | ||
RS612406 | 10 | 106005735 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.623E-6 | 0 | -22896 | gtex_brain_ba24 |
RS17883150 | 10 | 106013050 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.593E-7 | 0 | -15581 | gtex_brain_ba24 |
RS2164624 | 10 | 106013445 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.474E-7 | 0 | -15186 | gtex_brain_ba24 |
RS397752173 | 10 | 106014764 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.838E-6 | 0 | -13867 | gtex_brain_ba24 |
RS10883990 | 10 | 106018558 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.285E-7 | 0 | -10073 | gtex_brain_ba24 |
RS2282326 | 10 | 106020398 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 4.389E-8 | 0 | -8233 | gtex_brain_ba24 |
RS4925 | 10 | 106022789 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.258E-7 | 0 | -5842 | gtex_brain_ba24 |
RS11191979 | 10 | 106024867 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.258E-7 | 0 | -3764 | gtex_brain_ba24 |
RS1147611 | 10 | 106025258 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 4.331E-8 | 0 | -3373 | gtex_brain_ba24 |
RS45596840 | 10 | 106028154 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.238E-7 | 0 | -477 | gtex_brain_ba24 |
RS641071 | 10 | 106028157 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 4.267E-8 | 0 | -474 | gtex_brain_ba24 |
RS11191980 | 10 | 106032213 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.862e-8 | 0 | 3582 | gtex_brain_ba24 |
RS568526 | 10 | 106033439 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 8.599E-9 | 0 | 4808 | gtex_brain_ba24 |
RS17826034 | 10 | 106033504 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.862e-8 | 0 | 4873 | gtex_brain_ba24 |
RS2297235 | 10 | 106034491 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.862e-8 | 0 | 5860 | gtex_brain_ba24 |
RS276204 | 10 | 106035313 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 8.599E-9 | 0 | 6682 | gtex_brain_ba24 |
RS157077 | 10 | 106037894 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 7.852e-7 | 0 | 9263 | gtex_brain_ba24 |
RS7099030 | 10 | 106038347 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 3.782E-8 | 0 | 9716 | gtex_brain_ba24 |
RS156697 | 10 | 106039185 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 8.599E-9 | 0 | 10554 | gtex_brain_ba24 |
RS276203 | 10 | 106039303 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 8.599E-9 | 0 | 10672 | gtex_brain_ba24 |
RS6584592 | 10 | 106039780 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 3.839E-8 | 0 | 11149 | gtex_brain_ba24 |
RS1865926 | 10 | 106042502 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 4.301E-8 | 0 | 13871 | gtex_brain_ba24 |
RS7079338 | 10 | 106043132 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 7.904e-8 | 0 | 14501 | gtex_brain_ba24 |
RS397712198 | 10 | 106045962 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 3.507E-8 | 0 | 17331 | gtex_brain_ba24 |
RS276210 | 10 | 106046403 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.077E-8 | 0 | 17772 | gtex_brain_ba24 |
RS987247 | 10 | 106046768 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 6.741E-8 | 0 | 18137 | gtex_brain_ba24 |
RS157076 | 10 | 106048294 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.043e-8 | 0 | 19663 | gtex_brain_ba24 |
RS11191989 | 10 | 106050315 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 6.714E-8 | 0 | 21684 | gtex_brain_ba24 |
RS156699 | 10 | 106053641 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.069e-8 | 0 | 25010 | gtex_brain_ba24 |
RS157081 | 10 | 106055024 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.069e-8 | 0 | 26393 | gtex_brain_ba24 |
RS157080 | 10 | 106055963 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.069e-8 | 0 | 27332 | gtex_brain_ba24 |
RS3740466 | 10 | 106061169 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.196E-7 | 0 | 32538 | gtex_brain_ba24 |
RS397760147 | 10 | 106065999 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 7.905E-8 | 0 | 37368 | gtex_brain_ba24 |
RS11191999 | 10 | 106066436 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.656E-6 | 0 | 37805 | gtex_brain_ba24 |
RS11192001 | 10 | 106067978 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 6.714E-8 | 0 | 39347 | gtex_brain_ba24 |
RS201853039 | 10 | 106069081 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.75E-6 | 0 | 40450 | gtex_brain_ba24 |
RS199914302 | 10 | 106069085 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.279E-7 | 0 | 40454 | gtex_brain_ba24 |
RS10491046 | 10 | 106071001 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 6.714E-8 | 0 | 42370 | gtex_brain_ba24 |
RS276209 | 10 | 106072527 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.069e-8 | 0 | 43896 | gtex_brain_ba24 |
RS505701 | 10 | 106073566 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 2.069e-8 | 0 | 44935 | gtex_brain_ba24 |
RS11595547 | 10 | 106076414 | GSTO2 | ENSG0000000065621.10 | 1.538E-7 | 0 | 47783 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GSTO2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg谷胱甘肽代谢 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG药物代谢细胞色素P450 | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
维生素和辅因子的反应组代谢 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome谷胱甘肽结合 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome II期结合 | 70 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |