SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	12
Symbol	SERPINA3
同义词	AACT\|ACT\|GIG24\|GIG25
描述	serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 3
参考	MIM:107280\|HGNC:HGNC:16\|Ensembl:ENSG00000196136\|ENSEMBL：ENSG00000273259\|HPRD:00120\|Vega：Otthumg0000000029851
基因type	protein-coding
地图位置	14Q32.1
Pascal p-value	0.306
Sherlock P值	0.053
Fetal beta	-0.558
eGene	迈尔斯的顺式和跨性别
支持	G2Cdb.humanNRC G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
PMID:cooccur	高通量文献搜索	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Expression	基因表达的荟萃分析	Pvalue: 1.866
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症Co-occurance柯ywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias	Click to show details
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	Contribution to shortest path in PPI network: 0.0078

第一节遗传学和表观遗传学注释

eQTL annotation

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	基因Entrez ID	qvalue	eQTL type
rs2997198	chr1	80760865	SERPINA3	12	0.18	trans
rs16846456	chr3	172757337	SERPINA3	12	0.05	trans
rs9293020	chr5	22520547	SERPINA3	12	0.14	trans
RS16873760	chr6	45729388	SERPINA3	12	0.03	trans
RS16873861	chr6	45752854	SERPINA3	12	0.02	trans
rs11254107	chr10	16650659	SERPINA3	12	0.07	trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
NUDT18	0.54	0.43
SULT1A1	0.54	0.43
Shisa4	0.53	0.47
C6orf1	0.53	0.51
C12orf62	0.52	0.50
EGFL7	0.52	0.46
NDUFA7	0.52	0.45
C11orf59	0.52	0.44
ISOC2	0.52	0.53
LRRC29	0.52	0.47

Top 10 negatively co-expressed genes
基因	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
ZNF326	-0.38	-0.41
SFRS12	-0.38	-0.41
THOC2	-0.37	-0.40
PRPF38B	-0.36	-0.42
RBM25	-0.35	-0.41
MAP4K4	-0.35	-0.36
ZC3H13	-0.35	-0.35
HNRNPH3	-0.35	-0.40
PHF3	-0.35	-0.37
EIF3A	-0.35	-0.37

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0003677	DNA binding	IC		9880565
GO:0003677	DNA binding	塔斯		14668352
GO:0005515	protein binding	新闻学会		12709365\|14668352\|14687906
GO:0030569	chymotrypsin inhibitor activity	NAS		9880565
Biological process	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0006954	inflammatory response	NAS		12475184
GO:0006953	acute-phase response	IEA		-
GO:0019216	调节脂质代谢过程	NAS		11835318
细胞分量	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0005576	extracellular region	NAS		9880565\|14718574
GO:0005622	intracellular	NAS		9880565
GO:0005634	核	塔斯		14668352

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
APP	AAA \| ABETA \| ABPP \| AD1 \| APPI \| CTFgamma \| CVAP \| PN2	amyloid beta (A4) precursor protein	-	HPRD	2190106\|10048303
CMA1	赛\|MCT1 \|MGC119890 \|MGC119891 \|芝士酶	芝士酶1，肥大细胞	-	HPRD	8226889
CTRB1	CTRB \|FLJ42412 \|MGC88037	胰促合蛋白酶原B1	-	HPRD	2435303
CTRL	CTRL1 \| MGC70821	chymotrypsin-like	-	HPRD	8267879
CTSG	CG \| MGC23078	cathepsin G	Alpha-1 ACT interacts with and inhibits cathepsin G.	BIND	15131125
CTSG	CG \| MGC23078	cathepsin G	-	HPRD	8849841\|9698370 \|10512690
DNAJC1	DNAJL1 \|ERDJ1 \|HTJ1 \|MGC131954 \|mtj1	DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 1	-	HPRD，Biogrid	14668352
ELA1	-	elastase 1, pancreatic	-	HPRD	2456771\|7759598
ELA2	GE \|HLE \|hne \|NE \|PMN-E	elastase 2, neutrophil	-	HPRD，Biogrid	8011628\|8718849
ERBB2	CD340 \| HER-2 \| HER-2/neu \| HER2 \| NEU \| NGL \| TKR1	V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2，神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物（Avian）	-	HPRD	10829039
F5	FVL \| PCCF	凝血因子V（蛋白酶蛋白，不稳定因子）	-	HPRD	8216224
KLK2	KLK2A2 \| MGC12201 \| hK2	kallikrein-related peptidase 2	-	HPRD，Biogrid	9042371\|9428387
KLK3	APS \|KLK2A1 \|PSA \|HK3	kallikrein-related peptidase 3	-	HPRD	8732755\|9261179 \|10759471\|11317942 \|11735417
LRP1	A2MR \| APOER \| APR \| CD91 \| FLJ16451 \| IGFBP3R \| LRP \| MGC88725 \| TGFBR5	low density lipoprotein-related protein 1 (alpha-2-macroglobulin receptor)	LRP interacts with alpha-1-ACT.	BIND	15131125
MST1	D3F15S2 \|DNF15S2 \|HGFL \|MSP \|NF15S2	巨噬细胞刺激1（肝细胞生长因子样）	-	HPRD	11274154
POLA1	DKFZp686K1672 \| POLA \| p180	聚合酶（定向DNA），α1，催化亚基	-	HPRD	3490907

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT LATE UP	11	6	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 DN	175	82	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU CMYB TARGETS UP	165	106	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER BASAL VS MESENCHYMAL UP	121	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SABATES COLORECTAL ADENOMA UP	141	75	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN	781	465	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET CULTURED OVARIAN CANCER INVASIVE VS LMP DN	35	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ENDMETRIUM CANCER UP	25	17	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ENDOMETRIAL CANCER LATE	10	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B	392	251	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIYAR COBRA1 TARGETS UP	39	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS DN	193	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN HEAD AND NECK CANCER C	113	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤UP	35	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN	464	276	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHESLER BRAIN QTL CIS	75	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP	398	262	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC DN	63	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因	244	154	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB FAILED HEART ATRIUM DN	141	99	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN RESPONSE TO TNF UP	12	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉	244	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN RESPONSE TO TNF TROGLITAZONE UP	17	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN	245	144	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN	106	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB FAILED HEART VENTRICLE DN	41	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿	253	147	该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期16小时	40	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4	307	185	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN	220	147	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN	154	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCCABE BOUND BY HOXC6	469	239	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER LUMINAL B UP	172	109	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL UP	260	174	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP	425	298	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS EMT UP	36	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS UP	198	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES	389	245	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU VAV3 PROSTATE CARCINOGENESIS UP	89	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN	134	83	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHOEN NFKB SIGNALING	34	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S3	266	180	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN	1080	713	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 6	29	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上	146	75	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP	289	184	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM REGULATORS	238	125	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关	753	411	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵	1028	559	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因Page:SERPINA3