基因页面:FAT3
总结吗?
GeneID | 120114年 |
象征 | FAT3 |
同义词 | CDHF15 | CDHR10 | hFat3 |
描述 | 脂肪非典型钙粘着蛋白3 |
参考 | MIM: 612483|HGNC: HGNC: 23112|运用:ENSG00000165323|织女:OTTHUMG00000154468 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 11 q14.3 |
帕斯卡假定值 | 0.025 |
夏洛克假定值 | 0.528 |
胎儿β | 1.799 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs11000486 | chr10 | 74762547 | FAT3 | 120114年 | 0.15 | 反式 | ||
rs16930362 | chr10 | 74890320 | FAT3 | 120114年 | 0.2 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAT3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金赛的目标EWSR1 FLII融合DN | 329年 | 219年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赛尔维拉SDHB目标2 | 114年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO和H3K9ME3肝癌 | 141年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN HOELZEL NF1目标 | 115年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MIYAGAWA EWSR1 ETS的目标融合起来 | 259年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PECE乳腺干细胞DN | 146年 | 88年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |