基因页面:C12orf45
总结吗?
GeneID | 121053年 |
象征 | C12orf45 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 12号染色体开放阅读框45 |
参考 | HGNC: HGNC: 28628|运用:ENSG00000151131|HPRD: 17556| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 12 q23.3 |
帕斯卡假定值 | 0.768 |
夏洛克假定值 | 0.266 |
胎儿β | 0.162 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg13381646 | 12 | 105379979 | C12orf45 | 4.96 e-8 | -0.013 | 1.32 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6859281 | chr5 | 23770511 | C12orf45 | 121053年 | 0.03 | 反式 | ||
rs16923163 | chr8 | 59121076 | C12orf45 | 121053年 | 0.1 | 反式 | ||
rs5982838 | 0 | C12orf45 | 121053年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C12orf45_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHETH肝癌VS TXNIP PAM1损失 | 229年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
具备干细胞RAMALHO起来 | 206年 | 118年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SARTIPY正常胰岛素抵抗 | 34 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WARTERS反应红外皮肤 | 83年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |