基因页:LRIG3
概括?
基因 | 121227 |
象征 | LRIG3 |
同义词 | Lig3 |
描述 | 丰富的亮氨酸重复和免疫球蛋白类似域3 |
参考 | MIM:608870|HGNC:HGNC:30991|ENSEMBL:ENSG00000139263|HPRD:08317|Vega:Otthumg00000169940 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12q14.1 |
Pascal P值 | 0.27 |
胎儿β | 1.312 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15822795 | 12 | 59314530 | LRIG3 | 3.14e-9 | -0.024 | 2.12E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LRIG3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Corre多发性骨髓瘤DN | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PTCH1和Sufu的Lee目标 | 53 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Traynor Rett综合征 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild HRAS致癌特征 | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D | 89 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔内成熟DN | 99 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |