基因页面:IKBIP
总结吗?
| GeneID | 121457年 |
| 象征 | IKBIP |
| 同义词 | IKIP |
| 描述 | IKBKB相互作用的蛋白质 |
| 参考 | MIM: 609861|HGNC: HGNC: 26430|运用:ENSG00000166130|HPRD: 08092|织女:OTTHUMG00000170213 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 12 q23.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.733 |
| 胎儿β | 1.162 |
| eGene | 皮质 海马体 硬膜基底神经节 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IKBIP | chr12 | 99008054 | C | T | NM_201612 NM_201613 |
p.121R > H 。 |
错义 3-UTR |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg18466108 | 12 | 99038412 | APAF1; IKBIP | 1.595的军医 | -0.227 | 0.032 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4564386 | 12 | 99023846 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.945 e-6 | 0.03 | 15045年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs67721403 | 12 | 99027273 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.422 e-6 | 0.03 | 11618年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12371097 | 12 | 99029299 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.945 e-6 | 0.03 | 9592年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs201056003 | 12 | 99030691 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 3.271 e-6 | 0.03 | 8200年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3217465 | 12 | 99038708 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.805 e-6 | 0.03 | 183年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2278361 | 12 | 99043207 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.82 e-6 | 0.03 | -4316年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34144325 | 12 | 99044920 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.823 e-6 | 0.03 | -6029年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11109564 | 12 | 99059900 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.828 e-6 | 0.03 | -21009年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs35365649 | 12 | 99060627 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.828 e-6 | 0.03 | -21736年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11109565 | 12 | 99060813 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.828 e-6 | 0.03 | -21922年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7298561 | 12 | 99070843 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 2.505 e-6 | 0.03 | -31952年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3815997 | 12 | 99071023 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.828 e-6 | 0.03 | -32132年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7303874 | 12 | 99072233 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 2.58 e-6 | 0.03 | -33342年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2288725 | 12 | 99085026 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 3.004 e-6 | 0.03 | -46135年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2288724 | 12 | 99085027 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 3.004 e-6 | 0.03 | -46136年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6538879 | 12 | 99088094 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 2.507 e-6 | 0.03 | -49203年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12370618 | 12 | 99088223 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 1.828 e-6 | 0.03 | -49332年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2288719 | 12 | 99097911 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 2.275 e-6 | 0.03 | -59020年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7315547 | 12 | 99101441 | IKBIP | ENSG00000166130.10 | 2.741 e-6 | 0.03 | -62550年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周边与中央DN | 634年 | 384年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔鼻咽癌起来 | 294年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 加里CD5 DN的目标 | 431年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN | 460年 | 312年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良 | 633年 | 376年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| COLDREN吉非替尼耐药了 | 85年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCBRYAN发育期乳房4 5周 | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAIRKEE叔目标了 | 380年 | 213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOTTWEIN KSHV米尔K12 11的目标 | 63年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江缺氧正常 | 311年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN FOXP3目标集群P3 | 160年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |